48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4505 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4505  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  316  6e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0628  hypothetical protein  71.14 
 
 		 152 aa  221  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2066  hypothetical protein  71.83 
 
 		 156 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2299  hypothetical protein  67.97 
 
 		 156 aa  210  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2624  hypothetical protein  71.53 
 
 		 143 aa  205  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1062  hypothetical protein  66.44 
 
 		 301 aa  200  6e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2528  hypothetical protein  67.88 
 
 		 138 aa  198  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3351  hypothetical protein  68.94 
 
 		 140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1158  hypothetical protein  64.79 
 
 		 144 aa  186  9e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2747  hypothetical protein  60.27 
 
 		 147 aa  183  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2653  hypothetical protein  59.59 
 
 		 147 aa  179  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3195  hypothetical protein  60.15 
 
 		 182 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3840  hypothetical protein  58.78 
 
 		 138 aa  168  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2514  hypothetical protein  35.34 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0627  hypothetical protein  32.5 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0531  hypothetical protein  31.62 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.257553  normal  0.992847 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0841  hypothetical protein  36.28 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0625  hypothetical protein  36.28 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538203  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1807  hypothetical protein  36.28 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2298  hypothetical protein  30.89 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.879582 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2656  hypothetical protein  29.85 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1061  hypothetical protein  36.28 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2358  hypothetical protein  36.28 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1381  hypothetical protein  31.9 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2751  hypothetical protein  29.13 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1623  hypothetical protein  35.45 
 
 		 396 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1159  hypothetical protein  30.36 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0970  hypothetical protein  31.86 
 
 		 118 aa  47.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2065  hypothetical protein  31.03 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4622  hypothetical protein  28.04 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4506  hypothetical protein  32.74 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.633488 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5136  hypothetical protein  35.25 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745133  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03067  hypothetical protein  31.86 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1146  hypothetical protein  35.4 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961698  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0530  hypothetical protein  27.03 
 
 		 193 aa  45.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4835  hypothetical protein  30.28 
 
 		 131 aa  43.9  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3758  hypothetical protein  30.28 
 
 		 131 aa  43.9  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4111  hypothetical protein  29.31 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1212  hypothetical protein  33.05 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.407451  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8805  hypothetical protein  29.91 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6118  hypothetical protein  29.91 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3352  hypothetical protein  32.11 
 
 		 133 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8593  hypothetical protein  29.06 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4172  hypothetical protein  26.09 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.96777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4096  hypothetical protein  26.09 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4327  hypothetical protein  26.09 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.012726  normal  0.0625635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  28.57 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3985  hypothetical protein  31.62 
 
 		 140 aa  40.4  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>