25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3960 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3960  ABC transporter periplasmic solute-binding protein  100 
 
 		 375 aa  771    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3961  ABC transporter periplasmic solute-binding protein  61.33 
 
 		 374 aa  478  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1605  ABC transporter periplasmic solute-binding protein  53.45 
 
 		 372 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0296  ABC transporter periplasmic solute-binding protein  50 
 
 		 367 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.674577  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0507  ABC transporter periplasmic solute-binding protein  44.93 
 
 		 399 aa  311  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0960039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5559  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  39.65 
 
 		 389 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3480  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  31.61 
 
 		 391 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1842  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0219325  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1359  extracellular solute-binding protein family 1  22.98 
 
 		 338 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4244  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 		 366 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611623  normal  0.0395193 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4122  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 		 366 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 366 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3273  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 366 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281784  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  21.76 
 
 		 372 aa  47.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1767  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  22.78 
 
 		 366 aa  46.6  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  0.0378604 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5216  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 375 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5127  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 375 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0440  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.93 
 
 		 350 aa  46.6  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.576038  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3666  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 		 366 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.818754 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5507  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 375 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4140  extracellular solute-binding protein  22.4 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0884015  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1044  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  23.43 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1431  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 355 aa  43.1  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452816  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.6 
 
 		 362 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.6 
 
 		 362 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>