285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3344 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3344  adenosine deaminase  100 
 
 		 324 aa  653    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4468  adenosine deaminase  69.38 
 
 		 322 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0771279  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4180  adenosine deaminase  70.19 
 
 		 322 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0230  adenosine deaminase  70.28 
 
 		 332 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.278502  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3659  adenosine deaminase  63.21 
 
 		 325 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  41.49 
 
 		 326 aa  265  7e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0615  adenosine deaminase  41.8 
 
 		 326 aa  263  2e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2220  adenosine deaminase  47.65 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.679535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1597  adenosine deaminase  45 
 
 		 327 aa  255  6e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.750282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0250  adenosine deaminase  45 
 
 		 327 aa  255  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0278  adenosine deaminase  44.06 
 
 		 327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0830  adenosine deaminase  43.85 
 
 		 331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2984  adenosine deaminase  40.13 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208704  normal  0.261493 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  37.93 
 
 		 335 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  39.44 
 
 		 343 aa  200  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  37.34 
 
 		 346 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3044  adenosine deaminase  37.39 
 
 		 350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00967861  normal  0.0350825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0947  adenosine deaminase  37.35 
 
 		 350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  32.24 
 
 		 354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  36.53 
 
 		 341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  37.11 
 
 		 354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  37.61 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  36.42 
 
 		 341 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  36.42 
 
 		 341 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  36.28 
 
 		 682 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  36.28 
 
 		 682 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1040  adenosine deaminase  35.44 
 
 		 346 aa  182  7e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  35.91 
 
 		 346 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000592  adenosine deaminase  33.44 
 
 		 337 aa  182  9.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024296  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1487  adenosine deaminase  34.89 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0883  adenosine deaminase  36.22 
 
 		 341 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  33.96 
 
 		 345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2715  adenosine deaminase  33.76 
 
 		 339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  34.47 
 
 		 339 aa  179  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  37.15 
 
 		 341 aa  178  9e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  35.85 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1983  adenosine deaminase  36.78 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0456  adenosine deaminase  30.43 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  35.11 
 
 		 366 aa  176  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0809  adenosine deaminase  35.4 
 
 		 357 aa  175  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.429813  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2098  adenosine deaminase  35.8 
 
 		 345 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  32.79 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1925  adenosine deaminase  35.31 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10145  normal  0.0739212 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2249  adenosine deaminase  35.31 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  35.62 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0461  adenosine deaminase  34.97 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0168  adenosine deaminase  34.97 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2607  adenosine deaminase  34.97 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0979  adenosine deaminase  34.97 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3021  adenosine deaminase  34.97 
 
 		 341 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850327  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2976  adenosine deaminase  34.97 
 
 		 341 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  35.4 
 
 		 340 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2399  adenosine deaminase  32.81 
 
 		 355 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1001  adenosine deaminase  34.81 
 
 		 349 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1299  adenosine deaminase  38.44 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  34.49 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1359  adenosine deaminase  33.33 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  33.54 
 
 		 343 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  34.27 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  33.23 
 
 		 353 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1355  adenosine deaminase  35.05 
 
 		 348 aa  170  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630896  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  33.54 
 
 		 329 aa  169  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  31.99 
 
 		 335 aa  169  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2916  adenosine deaminase  34.66 
 
 		 341 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1083  adenosine deaminase  34.73 
 
 		 350 aa  169  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906329  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0661  adenosine deaminase  32.15 
 
 		 317 aa  168  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0757  adenosine deaminase  32.15 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2420  adenosine deaminase  31.66 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0868  adenosine deaminase  33.65 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  36.76 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  32.71 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  32.48 
 
 		 316 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5106  adenosine deaminase  36.81 
 
 		 349 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582125  normal  0.494241 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0591  adenosine deaminase  31.83 
 
 		 315 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0100  adenosine deaminase  33.02 
 
 		 374 aa  165  9e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151274 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  32.48 
 
 		 316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0671  adenosine deaminase  32.15 
 
 		 317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0631  adenosine deaminase  31.83 
 
 		 318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1236  adenosine deaminase  33.85 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0317068  normal  0.0334679 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1138  adenosine deaminase  35.71 
 
 		 375 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0503551  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  33.23 
 
 		 365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3597  adenosine deaminase  35.78 
 
 		 336 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2662  adenosine deaminase  36.5 
 
 		 342 aa  163  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1922  adenosine deaminase  28.53 
 
 		 335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4572  adenosine deaminase  31.61 
 
 		 315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000497344  hitchhiker  0.0072134 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2442  adenosine deaminase  36.82 
 
 		 350 aa  162  9e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02509  adenosine deaminase  30.72 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0990384  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  35.96 
 
 		 368 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3742  adenosine deaminase  33.33 
 
 		 356 aa  161  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1580  adenosine deaminase  31.58 
 
 		 344 aa  160  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0636  adenosine deaminase  30.87 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  hitchhiker  0.0000731257 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3185  adenosine deaminase  31.06 
 
 		 341 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  33.54 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2686  adenosine deaminase  34.74 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.806346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0282  adenosine deaminase  31.25 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0098  adenosine deaminase  33.02 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0116  adenosine deaminase  32.72 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0105  adenosine deaminase  32.72 
 
 		 376 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1524  adenosine deaminase  32.7 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4359  adenosine deaminase  35.08 
 
 		 357 aa  156  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>