38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3272 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3272  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  356  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3988  protein of unknown function DUF1052  79.87 
 
 		 164 aa  261  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4316  protein of unknown function DUF1052  79.22 
 
 		 164 aa  260  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0131225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0062  hypothetical protein  73.55 
 
 		 186 aa  236  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4040  hypothetical protein  67.1 
 
 		 182 aa  220  7e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.612895  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0151  hypothetical protein  63.87 
 
 		 164 aa  209  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0138  hypothetical protein  64.29 
 
 		 164 aa  204  7e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0132  hypothetical protein  64.29 
 
 		 176 aa  204  7e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00369415  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0573  protein of unknown function DUF1052  58.52 
 
 		 152 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0132  hypothetical protein  58.82 
 
 		 159 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0068  hypothetical protein  55.56 
 
 		 157 aa  159  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.721927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0307  hypothetical protein  56.2 
 
 		 152 aa  158  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.645888  normal  0.0582971 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7672  hypothetical protein  53.68 
 
 		 160 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0375  hypothetical protein  56.52 
 
 		 160 aa  157  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0717  hypothetical protein  55.15 
 
 		 159 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2789  protein of unknown function DUF1052  52.35 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.542945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2667  hypothetical protein  53.02 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2894  protein of unknown function DUF1052  53.02 
 
 		 161 aa  156  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.696295  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0232  hypothetical protein  51.32 
 
 		 163 aa  153  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.855134  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1054  protein of unknown function DUF1052  50.31 
 
 		 180 aa  153  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0112  hypothetical protein  53.68 
 
 		 163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1144  hypothetical protein  51.01 
 
 		 170 aa  150  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.896319 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1437  hypothetical protein  53.54 
 
 		 158 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2157  protein of unknown function DUF1052  54.07 
 
 		 161 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4208  hypothetical protein  50.81 
 
 		 152 aa  142  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0021  hypothetical protein  47.45 
 
 		 162 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0469027  normal  0.0489238 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2903  hypothetical protein  46.21 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0751  hypothetical protein  49.21 
 
 		 167 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2407  hypothetical protein  49.21 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0425  hypothetical protein  50 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.844666  normal  0.0652536 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1550  hypothetical protein  45.24 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0501323 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2122  hypothetical protein  43.65 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.653623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3406  hypothetical protein  45.08 
 
 		 150 aa  104  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2244  hypothetical protein  43.22 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2989  hypothetical protein  38.46 
 
 		 159 aa  94.4  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0369405 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3412  hypothetical protein  38.57 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.553828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2823  hypothetical protein  42.15 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.198959  normal  0.0930467 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0242  hypothetical protein  38.35 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>