29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0479 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2474  hypothetical protein  47.71 
 
 		 801 aa  694    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.958646 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0479  hypothetical protein  100 
 
 		 822 aa  1667    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0969  hypothetical protein  43.59 
 
 		 727 aa  592  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.685924  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5534  protein of unknown function DUF1217  35.59 
 
 		 738 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5254  protein of unknown function DUF1217  36.25 
 
 		 727 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0545  protein of unknown function DUF1217  30.53 
 
 		 1111 aa  293  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000988824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0592  protein of unknown function DUF1217  31.49 
 
 		 1111 aa  291  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.535986 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0251  hypothetical protein  37.97 
 
 		 259 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00748902  normal  0.467575 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4216  hypothetical protein  37.08 
 
 		 264 aa  162  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.338964  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0118  hypothetical protein  36.25 
 
 		 262 aa  157  8e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0302  hypothetical protein  36.17 
 
 		 258 aa  157  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.202407  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0127  hypothetical protein  35.83 
 
 		 258 aa  151  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1710  hypothetical protein  25.1 
 
 		 472 aa  134  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.214563  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1147  hypothetical protein  30.12 
 
 		 264 aa  131  6e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2809  hypothetical protein  30.08 
 
 		 259 aa  128  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.311131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1655  protein of unknown function DUF1217  33.74 
 
 		 259 aa  126  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.939234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6503  hypothetical protein  57.73 
 
 		 414 aa  118  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.019429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0691  protein of unknown function DUF1217  52.46 
 
 		 417 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396806  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0680  hypothetical protein  51.64 
 
 		 417 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0654  protein of unknown function DUF1217  50.43 
 
 		 417 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.202735 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6502  hypothetical protein  49.53 
 
 		 429 aa  109  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315608 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4200  flagellar protein, putative  36.44 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.628591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3881  flagellar basal-body rod protein FLGF  32.61 
 
 		 262 aa  73.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0287836  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4159  hypothetical protein  32.61 
 
 		 262 aa  72.8  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0365541  normal  0.446399 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3358  protein of unknown function DUF1217  26.07 
 
 		 263 aa  68.9  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1618  flagellar protein, putative  31.2 
 
 		 264 aa  67.4  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2971  hypothetical protein  33.33 
 
 		 650 aa  62.8  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.123475 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3449  hypothetical protein  23.95 
 
 		 281 aa  56.2  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.419129 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0105  hypothetical protein  20.54 
 
 		 290 aa  46.2  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>