17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3246 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3246  putative fimbrial protein  100 
 
 		 235 aa  477  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.106469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6643  putative fimbrial protein  35.68 
 
 		 273 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000724816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0345  putative fimbrial protein  34.95 
 
 		 236 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0338  putative fimbrial protein  34.95 
 
 		 236 aa  121  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.610599 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0217  putative fimbrial protein  34.76 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0419123 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3280  hypothetical protein  31.66 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0792859  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0603  hypothetical protein  31.66 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3565  hypothetical protein  30.65 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3389  putative CFA/I fimbrial subunit A  31.69 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0037  hypothetical protein  27.14 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3658  hypothetical protein  28.97 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0253  hypothetical protein  28.84 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3965  hypothetical protein  28.97 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5207  hypothetical protein  29.61 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2872  hypothetical protein  26.34 
 
 		 232 aa  52  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5211  hypothetical protein  26.04 
 
 		 228 aa  48.5  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3064  hypothetical protein  23.59 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0504389  normal  0.0240851 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>