38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2650 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2650  protein of unknown function DUF456  100 
 
 
161 aa  292  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.435877  normal  0.169604 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04813  hypothetical protein  62.5 
 
 
161 aa  193  8.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2638  hypothetical protein  49.67 
 
 
159 aa  125  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1793  hypothetical protein  45.39 
 
 
162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1010  hypothetical protein  46.2 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0973  protein of unknown function DUF456  45.34 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.344624 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1503  protein of unknown function DUF456  44.1 
 
 
161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108827  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0433  hypothetical protein  42.86 
 
 
171 aa  106  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1560  protein of unknown function DUF456  44.72 
 
 
161 aa  105  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0774261  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1732  hypothetical protein  42.24 
 
 
161 aa  97.1  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000256519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2010  hypothetical protein  37.93 
 
 
159 aa  93.6  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000106435  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2882  protein of unknown function DUF456  41.38 
 
 
159 aa  90.1  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0019277  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1006  hypothetical protein  40.6 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000095323  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2530  protein of unknown function DUF456  36 
 
 
157 aa  79  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1705  protein of unknown function DUF456  39.35 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1447  hypothetical protein  39.6 
 
 
165 aa  77  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.704764  normal  0.137111 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0954  protein of unknown function DUF456  37.59 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00446905  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0325  protein of unknown function DUF456  40 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.390841  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0314  protein of unknown function DUF456  40 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0303  hypothetical protein  40 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.853985  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0886  hypothetical protein  33.09 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1263  protein of unknown function DUF456  35.46 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1610  hypothetical protein  38.89 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.148481  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0075  protein of unknown function DUF456  29.22 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2062  hypothetical protein  47.06 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000914602  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1181  hypothetical protein  35.34 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4254  hypothetical protein  38.71 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632704  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3098  hypothetical protein  29.94 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1189  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1382  hypothetical protein  30.07 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.764083  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1881  hypothetical protein  30.37 
 
 
172 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575492 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0698  hypothetical protein  28.12 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0330  hypothetical protein  25.21 
 
 
162 aa  45.1  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0184  protein of unknown function DUF456  31.48 
 
 
167 aa  44.3  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.348806 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3993  hypothetical protein  36.64 
 
 
166 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0261  protein of unknown function DUF456  31.25 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0448  protein of unknown function DUF456  28.28 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0986569  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1078  hypothetical protein  47.62 
 
 
179 aa  42.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>