45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1078 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1078  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  313  9.999999999999999e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128864  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04813  hypothetical protein  36.26 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2638  hypothetical protein  36.63 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0075  protein of unknown function DUF456  34.21 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0886  hypothetical protein  35.62 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0954  protein of unknown function DUF456  34.78 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00446905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0973  protein of unknown function DUF456  33.13 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.344624 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1189  hypothetical protein  34.39 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2650  protein of unknown function DUF456  37.88 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.435877  normal  0.169604 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1793  hypothetical protein  32.7 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3098  hypothetical protein  30.81 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1006  hypothetical protein  37.97 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000095323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2010  hypothetical protein  27.16 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000106435  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1010  hypothetical protein  35.23 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2882  protein of unknown function DUF456  34.13 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0019277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1503  protein of unknown function DUF456  31.87 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2530  protein of unknown function DUF456  32.09 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1732  hypothetical protein  35.47 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000256519  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1447  hypothetical protein  36.31 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.704764  normal  0.137111 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1610  hypothetical protein  32.22 
 
 		 159 aa  54.3  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.148481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1560  protein of unknown function DUF456  35.84 
 
 		 161 aa  52.8  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0774261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0303  hypothetical protein  30.99 
 
 		 159 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.853985  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1705  protein of unknown function DUF456  44.12 
 
 		 162 aa  51.2  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0314  protein of unknown function DUF456  30.99 
 
 		 159 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0325  protein of unknown function DUF456  30.99 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.390841  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0433  hypothetical protein  31.98 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1098  protein of unknown function DUF456  38.1 
 
 		 168 aa  49.3  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0512381 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0698  hypothetical protein  26.19 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1263  protein of unknown function DUF456  35 
 
 		 172 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5072  protein of unknown function DUF456  30.38 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1382  hypothetical protein  26.09 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.764083  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1154  protein of unknown function DUF456  33.85 
 
 		 169 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.147435 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0261  protein of unknown function DUF456  33.91 
 
 		 168 aa  45.1  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2049  hypothetical protein  21.77 
 
 		 160 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3260  hypothetical protein  21.77 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.897225 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1181  hypothetical protein  29.94 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2127  hypothetical protein  20.97 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.87001  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0330  hypothetical protein  22.09 
 
 		 162 aa  43.5  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0940  protein of unknown function DUF456  42.86 
 
 		 200 aa  42  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2091  hypothetical protein  20.97 
 
 		 160 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2159  hypothetical protein  20.97 
 
 		 160 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00020937  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2058  hypothetical protein  20.97 
 
 		 160 aa  41.2  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1865  hypothetical protein  20.97 
 
 		 160 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.215956  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1874  hypothetical protein  20.97 
 
 		 160 aa  41.2  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00711757  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1912  hypothetical protein  20.97 
 
 		 160 aa  41.2  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>