43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1610 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1610  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  294  4e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.148481  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1263  protein of unknown function DUF456  65.41 
 
 
172 aa  199  9e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1447  hypothetical protein  44.22 
 
 
165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.704764  normal  0.137111 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2882  protein of unknown function DUF456  39.42 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0019277  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2010  hypothetical protein  31.88 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000106435  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0954  protein of unknown function DUF456  35.07 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00446905  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1181  hypothetical protein  50 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0075  protein of unknown function DUF456  39.26 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1793  hypothetical protein  37.96 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04813  hypothetical protein  41.84 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2530  protein of unknown function DUF456  33.07 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0330  hypothetical protein  33.68 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0886  hypothetical protein  37.1 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0184  protein of unknown function DUF456  34.51 
 
 
167 aa  67.4  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.348806 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2049  hypothetical protein  27.61 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299091  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1874  hypothetical protein  25.17 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00711757  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2159  hypothetical protein  25.17 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00020937  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1010  hypothetical protein  34.9 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2091  hypothetical protein  25.17 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1865  hypothetical protein  25.17 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.215956  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2058  hypothetical protein  25.17 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1912  hypothetical protein  25.17 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2638  hypothetical protein  38.62 
 
 
159 aa  60.8  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3260  hypothetical protein  26.87 
 
 
160 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.897225 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1909  hypothetical protein  24.63 
 
 
160 aa  58.9  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2127  hypothetical protein  25.37 
 
 
160 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.87001  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11270  hypothetical protein  30.3 
 
 
161 aa  57.8  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0350705  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1705  protein of unknown function DUF456  37.68 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2650  protein of unknown function DUF456  36.96 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.435877  normal  0.169604 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1382  hypothetical protein  41.1 
 
 
154 aa  55.1  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.764083  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1006  hypothetical protein  38.76 
 
 
161 aa  54.7  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000095323  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0973  protein of unknown function DUF456  40.7 
 
 
161 aa  54.3  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.344624 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0698  hypothetical protein  27.97 
 
 
162 aa  51.2  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1547  hypothetical protein  22.82 
 
 
160 aa  50.4  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0619985  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1098  protein of unknown function DUF456  41.86 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0512381 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1503  protein of unknown function DUF456  37.33 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108827  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3098  hypothetical protein  33.57 
 
 
162 aa  47  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0261  protein of unknown function DUF456  30.77 
 
 
168 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1560  protein of unknown function DUF456  40.74 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0774261  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0433  hypothetical protein  44.26 
 
 
171 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0940  protein of unknown function DUF456  29.17 
 
 
200 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2062  hypothetical protein  44.71 
 
 
159 aa  40.8  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000914602  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0448  protein of unknown function DUF456  29.93 
 
 
161 aa  40.8  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0986569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>