38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0184 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0184  protein of unknown function DUF456  100 
 
 
167 aa  317  6e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.348806 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1610  hypothetical protein  35.29 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.148481  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2010  hypothetical protein  35.57 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000106435  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2638  hypothetical protein  37.65 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1263  protein of unknown function DUF456  36.36 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0954  protein of unknown function DUF456  34.04 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00446905  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2530  protein of unknown function DUF456  33.55 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1010  hypothetical protein  31.25 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1447  hypothetical protein  35.03 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.704764  normal  0.137111 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0973  protein of unknown function DUF456  36.84 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.344624 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2882  protein of unknown function DUF456  36.3 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0019277  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0886  hypothetical protein  33.56 
 
 
159 aa  62  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1382  hypothetical protein  31.82 
 
 
154 aa  61.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.764083  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0433  hypothetical protein  30.25 
 
 
171 aa  58.2  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0075  protein of unknown function DUF456  31.69 
 
 
160 aa  58.2  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04813  hypothetical protein  32.41 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1705  protein of unknown function DUF456  32.9 
 
 
162 aa  55.1  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1503  protein of unknown function DUF456  32.48 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108827  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3098  hypothetical protein  28.57 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1912  hypothetical protein  30.77 
 
 
160 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1874  hypothetical protein  30.77 
 
 
160 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00711757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1865  hypothetical protein  30.77 
 
 
160 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.215956  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2058  hypothetical protein  30.77 
 
 
160 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2091  hypothetical protein  30.77 
 
 
160 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2159  hypothetical protein  30.77 
 
 
160 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00020937  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1547  hypothetical protein  29.61 
 
 
160 aa  52  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0619985  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2049  hypothetical protein  29.23 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299091  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0330  hypothetical protein  22 
 
 
162 aa  50.8  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3260  hypothetical protein  29.23 
 
 
160 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.897225 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1793  hypothetical protein  34.39 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2127  hypothetical protein  29.23 
 
 
160 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.87001  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1909  hypothetical protein  28.46 
 
 
160 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1560  protein of unknown function DUF456  35.54 
 
 
161 aa  48.5  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0774261  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1006  hypothetical protein  37.01 
 
 
161 aa  47.8  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000095323  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2650  protein of unknown function DUF456  31.54 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.435877  normal  0.169604 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1098  protein of unknown function DUF456  35.96 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0512381 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1181  hypothetical protein  30.21 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1732  hypothetical protein  30.54 
 
 
161 aa  41.2  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000256519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>