31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1560 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1560  protein of unknown function DUF456  100 
 
 		 161 aa  285  2.9999999999999996e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0774261  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0433  hypothetical protein  60.25 
 
 		 171 aa  168  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1732  hypothetical protein  62.11 
 
 		 161 aa  167  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000256519  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1503  protein of unknown function DUF456  56.52 
 
 		 161 aa  148  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0973  protein of unknown function DUF456  57.82 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.344624 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2638  hypothetical protein  51.33 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1793  hypothetical protein  46.79 
 
 		 162 aa  119  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04813  hypothetical protein  41.94 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1010  hypothetical protein  45.39 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2650  protein of unknown function DUF456  44.72 
 
 		 161 aa  107  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.435877  normal  0.169604 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2062  hypothetical protein  51.57 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000914602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2010  hypothetical protein  35.62 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000106435  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0325  protein of unknown function DUF456  40.31 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.390841  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0314  protein of unknown function DUF456  40.31 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0303  hypothetical protein  40.31 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.853985  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2882  protein of unknown function DUF456  34.03 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0019277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0954  protein of unknown function DUF456  35.29 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00446905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2530  protein of unknown function DUF456  38.14 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0886  hypothetical protein  40 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3098  hypothetical protein  30.97 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1006  hypothetical protein  35.46 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000095323  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0184  protein of unknown function DUF456  36.57 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.348806 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4254  hypothetical protein  41.61 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1263  protein of unknown function DUF456  38.06 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1447  hypothetical protein  34.56 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.704764  normal  0.137111 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1705  protein of unknown function DUF456  35.67 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1181  hypothetical protein  37.3 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1610  hypothetical protein  39.18 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.148481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1382  hypothetical protein  30.68 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.764083  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1189  hypothetical protein  27.34 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0698  hypothetical protein  31.68 
 
 		 162 aa  40.4  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>