43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2638 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2638  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  290  5e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1503  protein of unknown function DUF456  57.42 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04813  hypothetical protein  47.83 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0973  protein of unknown function DUF456  54.17 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.344624 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0433  hypothetical protein  50.32 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1010  hypothetical protein  49.35 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2650  protein of unknown function DUF456  49.04 
 
 		 161 aa  120  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.435877  normal  0.169604 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1793  hypothetical protein  46.2 
 
 		 162 aa  120  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1560  protein of unknown function DUF456  51.33 
 
 		 161 aa  117  6e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0774261  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1732  hypothetical protein  49.33 
 
 		 161 aa  114  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000256519  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2882  protein of unknown function DUF456  37.11 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0019277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2530  protein of unknown function DUF456  37.91 
 
 		 157 aa  94.4  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2010  hypothetical protein  35.48 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000106435  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0325  protein of unknown function DUF456  50 
 
 		 159 aa  90.5  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.390841  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1705  protein of unknown function DUF456  43.59 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0314  protein of unknown function DUF456  50 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0303  hypothetical protein  50 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.853985  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0954  protein of unknown function DUF456  37.41 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00446905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2062  hypothetical protein  55.7 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000914602  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3098  hypothetical protein  38.36 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0886  hypothetical protein  40 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0075  protein of unknown function DUF456  32.26 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0184  protein of unknown function DUF456  39.23 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.348806 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1447  hypothetical protein  42.96 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.704764  normal  0.137111 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1610  hypothetical protein  38.62 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.148481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4254  hypothetical protein  48.46 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1263  protein of unknown function DUF456  38.36 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1006  hypothetical protein  37.96 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000095323  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1181  hypothetical protein  35.04 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1382  hypothetical protein  28.77 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.764083  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5072  protein of unknown function DUF456  36.05 
 
 		 180 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1189  hypothetical protein  29.5 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1881  hypothetical protein  34.21 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575492 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0698  hypothetical protein  24.03 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0330  hypothetical protein  25.31 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2049  hypothetical protein  27.61 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299091  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1547  hypothetical protein  29.67 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0619985  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0448  protein of unknown function DUF456  27.21 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0986569  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1098  protein of unknown function DUF456  31.58 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0512381 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3260  hypothetical protein  26.99 
 
 		 160 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.897225 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2127  hypothetical protein  27.4 
 
 		 160 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.87001  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0940  protein of unknown function DUF456  39.08 
 
 		 200 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1909  hypothetical protein  25.77 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>