37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0325 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0325  protein of unknown function DUF456  100 
 
 
159 aa  276  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.390841  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0314  protein of unknown function DUF456  99.37 
 
 
159 aa  274  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0303  hypothetical protein  99.37 
 
 
159 aa  274  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.853985  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4254  hypothetical protein  68.15 
 
 
160 aa  121  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632704  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0973  protein of unknown function DUF456  46.53 
 
 
161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.344624 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1793  hypothetical protein  44.3 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2638  hypothetical protein  48 
 
 
159 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1010  hypothetical protein  45.45 
 
 
160 aa  104  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0433  hypothetical protein  46.1 
 
 
171 aa  99.8  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1732  hypothetical protein  46 
 
 
161 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000256519  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04813  hypothetical protein  37.25 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1503  protein of unknown function DUF456  48.18 
 
 
161 aa  89.4  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108827  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2650  protein of unknown function DUF456  38.46 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.435877  normal  0.169604 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1560  protein of unknown function DUF456  40.94 
 
 
161 aa  84.3  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0774261  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2010  hypothetical protein  35.56 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000106435  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0954  protein of unknown function DUF456  36.92 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00446905  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2530  protein of unknown function DUF456  33.91 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3098  hypothetical protein  33.99 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2062  hypothetical protein  47.02 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000914602  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1705  protein of unknown function DUF456  36.6 
 
 
162 aa  61.6  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2882  protein of unknown function DUF456  30.88 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0019277  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0886  hypothetical protein  37.68 
 
 
159 aa  58.9  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1382  hypothetical protein  31.21 
 
 
154 aa  57  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.764083  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1189  hypothetical protein  32.59 
 
 
150 aa  55.1  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1181  hypothetical protein  31.58 
 
 
161 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1006  hypothetical protein  35.66 
 
 
161 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000095323  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0075  protein of unknown function DUF456  26.49 
 
 
160 aa  51.6  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0448  protein of unknown function DUF456  29.32 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0986569  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1447  hypothetical protein  34.64 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.704764  normal  0.137111 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0698  hypothetical protein  25 
 
 
162 aa  47.4  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1881  hypothetical protein  46.15 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575492 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1263  protein of unknown function DUF456  32.87 
 
 
172 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11270  hypothetical protein  29.21 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0350705  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0184  protein of unknown function DUF456  31.58 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.348806 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2619  protein of unknown function DUF456  32.54 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.145913  normal  0.479134 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0330  hypothetical protein  24.58 
 
 
162 aa  41.6  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2049  hypothetical protein  23.29 
 
 
160 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>