30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3098 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3098  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  299  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2638  hypothetical protein  38.36 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2530  protein of unknown function DUF456  38.82 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0433  hypothetical protein  32.24 
 
 
171 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1793  hypothetical protein  32.05 
 
 
162 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0886  hypothetical protein  34.51 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0973  protein of unknown function DUF456  31.97 
 
 
161 aa  60.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.344624 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04813  hypothetical protein  29.87 
 
 
161 aa  57.8  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1010  hypothetical protein  29.87 
 
 
160 aa  57  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1503  protein of unknown function DUF456  32.26 
 
 
161 aa  57  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108827  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2010  hypothetical protein  30.82 
 
 
159 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000106435  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1560  protein of unknown function DUF456  30.92 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0774261  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2650  protein of unknown function DUF456  29.94 
 
 
161 aa  51.6  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.435877  normal  0.169604 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2882  protein of unknown function DUF456  30.86 
 
 
159 aa  51.2  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0019277  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0075  protein of unknown function DUF456  29.45 
 
 
160 aa  50.8  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0325  protein of unknown function DUF456  37.5 
 
 
159 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.390841  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1447  hypothetical protein  35.61 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.704764  normal  0.137111 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1382  hypothetical protein  25.17 
 
 
154 aa  50.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.764083  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1705  protein of unknown function DUF456  31.18 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0314  protein of unknown function DUF456  37.5 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0303  hypothetical protein  37.5 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.853985  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1610  hypothetical protein  33.57 
 
 
159 aa  47  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.148481  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1732  hypothetical protein  29.22 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000256519  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0184  protein of unknown function DUF456  28.57 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.348806 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0698  hypothetical protein  24.53 
 
 
162 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0330  hypothetical protein  26.81 
 
 
162 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1181  hypothetical protein  32.97 
 
 
161 aa  44.3  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0954  protein of unknown function DUF456  31.72 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00446905  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1263  protein of unknown function DUF456  31.13 
 
 
172 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1547  hypothetical protein  30.59 
 
 
160 aa  42  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0619985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>