43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2648 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2648  17 kDa surface antigen  100 
 
 
164 aa  317  6e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.406999  normal  0.161516 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04811  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  59.76 
 
 
159 aa  166  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.671039  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0885  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein precursor  56.1 
 
 
153 aa  144  8.000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0799  17 kDa surface antigen  56.1 
 
 
153 aa  131  5e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2480  17 kDa surface antigen-like protein  35.63 
 
 
177 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0840  17 kDa surface antigen  35.8 
 
 
168 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0572265 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  34.59 
 
 
165 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  34.59 
 
 
165 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0769  17 kDa surface antigen  36.3 
 
 
163 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529266  normal  0.0236925 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0849  17 kDa surface antigen  37.06 
 
 
172 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1189  17 kDa surface antigen  34.27 
 
 
186 aa  47.8  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476114  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  31.29 
 
 
272 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5096  17 kDa surface antigen  39.71 
 
 
190 aa  45.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254205  normal  0.114391 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  35.42 
 
 
208 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0899  outer membrane lipoprotein transmembrane  39.39 
 
 
167 aa  45.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00272241  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  31.29 
 
 
215 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  32.98 
 
 
225 aa  45.1  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  26.67 
 
 
206 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  28.35 
 
 
204 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  31.29 
 
 
215 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  50 
 
 
179 aa  44.7  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  50 
 
 
179 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  50 
 
 
179 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  50 
 
 
179 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  50 
 
 
179 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  50 
 
 
179 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  50 
 
 
179 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  50 
 
 
179 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3177  17 kDa surface antigen  38.02 
 
 
164 aa  44.3  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  50 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  32.21 
 
 
218 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  32.21 
 
 
218 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  32.21 
 
 
218 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  32.21 
 
 
218 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  31.54 
 
 
218 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  32.21 
 
 
218 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  32.21 
 
 
218 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  39.24 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  39.24 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  39.24 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  39.24 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  39.24 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1300  17 kDa surface antigen  32.14 
 
 
155 aa  41.6  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.843728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>