20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2049 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2049  multi-copper enzyme maturase ABC-type transport system permease component-like protein  100 
 
 
452 aa  869    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3359  hypothetical protein  29.12 
 
 
491 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04087  hypothetical protein  32.04 
 
 
422 aa  117  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0683  hypothetical protein  24.5 
 
 
463 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4459  hypothetical protein  29.04 
 
 
454 aa  98.2  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.448682  normal  0.0102439 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3333  hypothetical protein  22.09 
 
 
449 aa  87  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437943  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5323  hypothetical protein  24.59 
 
 
482 aa  84.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3608  hypothetical protein  24.23 
 
 
417 aa  83.6  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.789533  decreased coverage  0.0000392195 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3775  hypothetical protein  21.69 
 
 
436 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  21.57 
 
 
483 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300875  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01805  hypothetical protein  23.73 
 
 
436 aa  75.1  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3360  hypothetical protein  30.15 
 
 
465 aa  57  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.435546 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  31.76 
 
 
283 aa  50.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3124  ABC transporter permease protein  31.3 
 
 
318 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01817  hypothetical protein  28.65 
 
 
470 aa  45.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000241267  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  30.89 
 
 
272 aa  44.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1578  hypothetical protein  30.4 
 
 
359 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  34.59 
 
 
275 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  20.97 
 
 
301 aa  43.5  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04086  hypothetical protein  33.33 
 
 
475 aa  43.1  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>