24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0553 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0553  Fimbrial assembly family protein  100 
 
 		 379 aa  725    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0642076 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02683  general secretion pathway protein L  56.3 
 
 		 373 aa  330  4e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0776  fimbrial assembly family protein  49.74 
 
 		 378 aa  320  3e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0393461  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0863  general secretory pathway protein L  49.47 
 
 		 378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00948557  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0758  general secretion pathway protein L  34.39 
 
 		 373 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0966219  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2176  fimbrial assembly family protein  31.38 
 
 		 346 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3310  general secretion pathway protein L, putative  30.99 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1121  general secretion pathway protein l, putative  25.53 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3144  fimbrial assembly  30.79 
 
 		 364 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1306  fimbrial assembly family protein  26.8 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.838759  decreased coverage  0.00904381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1285  putative general secretion pathway protein L, GspL  24.91 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.442557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0734  fimbrial assembly  26.35 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0675563  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0917  Fimbrial assembly family protein  24.8 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3002  fimbrial assembly  27.82 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2619  putative general secretion pathway protein L  28.97 
 
 		 365 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4153  fimbrial assembly family protein  25 
 
 		 437 aa  50.1  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0256547  hitchhiker  0.0000649837 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2027  fimbrial assembly family protein  28.77 
 
 		 353 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2114  fimbrial assembly family protein  31.25 
 
 		 359 aa  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0463917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0827  fimbrial assembly family protein  22.81 
 
 		 187 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.839897  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1788  Fimbrial assembly family protein  28.93 
 
 		 355 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0126663  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4955  fimbrial assembly family protein  29.66 
 
 		 178 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1521  Fimbrial assembly family protein  44.44 
 
 		 332 aa  43.5  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0573904  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5082  fimbrial assembly family protein  30.34 
 
 		 178 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1590  fimbrial assembly family protein  29.27 
 
 		 355 aa  43.1  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.493789  normal  0.437646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>