143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6996 on replicon NC_013733
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013733  Slin_6996  ATPase-like protein involved in chromosome partitioning  100 
 
 
180 aa  358  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185924  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.44 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.02 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.02 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.44 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.01 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.26 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.12 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  27.93 
 
 
209 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.38 
 
 
212 aa  63.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.33 
 
 
217 aa  63.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.79 
 
 
216 aa  62.8  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.49 
 
 
212 aa  62.8  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.37 
 
 
221 aa  62.4  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.65 
 
 
217 aa  62.4  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.69 
 
 
212 aa  61.6  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.11 
 
 
212 aa  62  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  26.63 
 
 
220 aa  61.6  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.37 
 
 
211 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.7 
 
 
214 aa  61.2  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1680  hypothetical protein  27.15 
 
 
211 aa  61.2  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.14 
 
 
222 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  25.29 
 
 
207 aa  60.5  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1378  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.15 
 
 
211 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.626674  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.9 
 
 
217 aa  60.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.26 
 
 
217 aa  60.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.67 
 
 
212 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5082  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.37 
 
 
227 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.161986 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.27 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.46 
 
 
212 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.16 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.59 
 
 
212 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  27.69 
 
 
309 aa  58.9  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.22 
 
 
217 aa  58.9  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.73 
 
 
212 aa  58.9  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.59 
 
 
212 aa  58.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.07 
 
 
212 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  24.73 
 
 
212 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7432  putative partition protein  30.68 
 
 
212 aa  58.2  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.529714 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 
209 aa  57.4  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  23.31 
 
 
212 aa  57.4  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.81 
 
 
211 aa  57  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.73 
 
 
212 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.14 
 
 
212 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.68 
 
 
212 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  24.73 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.23 
 
 
210 aa  56.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.73 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  28.74 
 
 
206 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.15 
 
 
212 aa  55.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.04 
 
 
212 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 
212 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.15 
 
 
212 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.15 
 
 
212 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.77 
 
 
216 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.91 
 
 
216 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  26.32 
 
 
212 aa  55.5  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1536  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.06 
 
 
210 aa  54.7  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116113  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1953  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.74 
 
 
187 aa  54.3  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.28 
 
 
211 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  28.68 
 
 
223 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.92 
 
 
212 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.44 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.62 
 
 
212 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.24 
 
 
192 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.32 
 
 
220 aa  52  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.84 
 
 
220 aa  51.6  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  27.4 
 
 
220 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  27.4 
 
 
220 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  27.4 
 
 
220 aa  51.6  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.5 
 
 
212 aa  51.6  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  27.4 
 
 
220 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  27.4 
 
 
220 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  27.4 
 
 
220 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  27.4 
 
 
220 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  27.4 
 
 
220 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  28.17 
 
 
220 aa  51.2  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.16 
 
 
226 aa  50.8  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.71 
 
 
220 aa  50.8  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.71 
 
 
220 aa  50.8  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.71 
 
 
220 aa  50.8  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.71 
 
 
211 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  25 
 
 
225 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.61 
 
 
215 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26 
 
 
212 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03280  parA family protein  26.78 
 
 
231 aa  50.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.55 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.55 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.55 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.46 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3315  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.41 
 
 
223 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.08 
 
 
215 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.79 
 
 
232 aa  48.9  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.23 
 
 
223 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.12 
 
 
276 aa  48.5  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1305  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.23 
 
 
223 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.153977  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.16 
 
 
226 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.35 
 
 
211 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.35 
 
 
211 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  24.6 
 
 
240 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>