68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6952 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013732  Slin_6952  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  504  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.75245 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2270  hypothetical protein  41.37 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.239971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0399  extracellular solute-binding protein family 1  40.82 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3615  hypothetical protein  39.27 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.520257  hitchhiker  0.00533129 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2390  AcfC-like protein  36.33 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0799  major antigenic peptide PEB2  32.8 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.646416  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0869  major antigenic peptide PEB2  32.4 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.572076  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0366  accessory colonization factor AcfC  32.94 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0726  major antigenic peptide PEB2  29.65 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.1322  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1760  porcine attaching-effacing associated protein  32.76 
 
 		 248 aa  125  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000702391  normal  0.0238437 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1380  major antigenic peptide PEB3  33.33 
 
 		 249 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00556  accessory colonization factor  31.13 
 
 		 265 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4641  extracellular solute-binding protein  33.73 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0315  major antigenic peptide PEB3  32.34 
 
 		 250 aa  112  8.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0415  hypothetical protein  30.53 
 
 		 243 aa  111  9e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000733023  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0337  major antigenic peptide PEB3  32.34 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2782  ABC-type transport system, periplasmic component  25 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.3240399999999997e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1978  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.81 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.201567 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1884  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.01 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1585  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.12 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.296141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1757  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.05 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1307  molybdate-binding protein  21.93 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.590504 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11885  molybdate-binding lipoprotein modA  26.8 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.189903 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2326  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate- binding protein  30.52 
 
 		 334 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000119117  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0208  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.05 
 
 		 291 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.726895  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0259  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.81 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1020  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.63 
 
 		 280 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.73823  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1334  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.55 
 
 		 281 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.36729  normal  0.0167209 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1619  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  20.17 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0273335  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1319  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.32 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0384  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.33 
 
 		 260 aa  52.4  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1528  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.27 
 
 		 260 aa  52  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00368148 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0924  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  21.48 
 
 		 267 aa  52.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0328  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  20.32 
 
 		 260 aa  52  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3266  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.08 
 
 		 272 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1444  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.75 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.448205  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1821  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.58 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.233518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2732  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.92 
 
 		 248 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3319  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.03 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2302  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.23 
 
 		 255 aa  48.5  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2226  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.68 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.78167e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1547  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2901  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  19.37 
 
 		 400 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5198  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.15 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2499  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.37 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0035  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.8 
 
 		 246 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155625 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0054  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.28 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0160999  normal  0.0260306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0045  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.28 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3697  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  29.22 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3447  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.46 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0367  molybdenum ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  23.6 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1824  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.6 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.694807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2545  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.68 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.778836  normal  0.889945 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1069  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  33.61 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2427  molybdate ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.56 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4509  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.06 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1974  type I restriction-modification system, M subunit  22.92 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1094  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.22 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2650  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  21.58 
 
 		 286 aa  43.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1556  ABC-type molybdate transport system periplasmic component-like protein  23.44 
 
 		 276 aa  43.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0963  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.31 
 
 		 256 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4992  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  21.86 
 
 		 263 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3425  molybdenum ABC transporter, solute-binding protein  22.28 
 
 		 272 aa  42.4  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0881211 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1534  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  20.83 
 
 		 258 aa  42.7  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.133844  hitchhiker  0.00863376 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0106  putative molybdate-binding periplasmic signal peptide protein  21.05 
 
 		 257 aa  42.4  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.173148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2906  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.11 
 
 		 274 aa  42.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000609302  hitchhiker  0.0000154975 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1443  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.81 
 
 		 270 aa  42.4  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.640013  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2961  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  29.56 
 
 		 338 aa  42  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>