32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6677 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013731  Slin_6677  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  457  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000431405  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0007  hypothetical protein  34.91 
 
 
248 aa  123  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231859  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0452  hypothetical protein  32.16 
 
 
229 aa  105  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1500  OmpA/MotB domain protein  32.43 
 
 
253 aa  98.2  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3889  hypothetical protein  32.33 
 
 
235 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5802  hypothetical protein  31.9 
 
 
235 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0396159  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4823  hypothetical protein  31.9 
 
 
235 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4266  hypothetical protein  25.36 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4587  hypothetical protein  27.73 
 
 
234 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4617  hypothetical protein  26.05 
 
 
247 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0284  hypothetical protein  26.51 
 
 
246 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0999  OmpA/MotB domain-containing protein  27.88 
 
 
255 aa  52.8  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0911  chemotaxis protein MotB, putative  29.5 
 
 
316 aa  52  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0745423  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3412  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like protein  27.78 
 
 
220 aa  51.6  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1008  hypothetical protein  25.77 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0954  hypothetical protein  27.49 
 
 
243 aa  48.9  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.636597  unclonable  0.0000321673 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3305  OmpA/MotB domain protein  29.94 
 
 
296 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0627  chemotaxis protein MotB, putative  27.46 
 
 
317 aa  48.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0702  chemotaxis protein MotB, putative  27.46 
 
 
317 aa  48.1  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.66676  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3786  chemotaxis protein MotB-related protein  23.77 
 
 
243 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1070  chemotaxis protein MotB, putative  26.76 
 
 
317 aa  45.8  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.98925  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1663  hypothetical protein  30.82 
 
 
575 aa  45.4  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0111  putative chemotaxis protein MotB  28.99 
 
 
366 aa  45.1  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.876361  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  37.78 
 
 
412 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003240  chemotaxis protein MotB-related protein  23.89 
 
 
244 aa  43.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1218  putative chemotaxis protein MotB  23.96 
 
 
337 aa  43.1  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0231  hypothetical protein  23.57 
 
 
230 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.317475  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0232  hypothetical protein  23.57 
 
 
230 aa  42.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  37.25 
 
 
1987 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2072  putative chemotaxis protein MotB  27.34 
 
 
363 aa  42.7  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.291136  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3877  OmpA/MotB domain protein  29.41 
 
 
222 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1361  hypothetical protein  26.09 
 
 
244 aa  42  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>