47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5685 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5685  Glycosyl transferase-like protein UDP- glucuronosyltransferase  100 
 
 
382 aa  795    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3660  putative glycosyltransferase  42.18 
 
 
373 aa  310  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359283  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2563  UDP- glucuronosyltransferase-like glycosyl transferase  42.9 
 
 
371 aa  280  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504516  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0449  Glycosyltransferase 28 domain protein  27.83 
 
 
377 aa  112  9e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2842  UDP-glucuronosyltransferase-like protein  26.8 
 
 
371 aa  98.2  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2719  teichoic acid biosynthesis related protein  27.35 
 
 
388 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.194172  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0253  teichoic acid biosynthesis related protein  27.18 
 
 
366 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0336  teichoic acid biosynthesis related protein  26.47 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1851  hypothetical protein  22.53 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.316148  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1235  teichoic acid biosynthesis related protein  23.94 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6653  putative UDP-glucuronosyltransferase  26.4 
 
 
359 aa  69.7  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.109077 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0675  hypothetical protein  25.6 
 
 
343 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.575182  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0795  hypothetical protein  24.78 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0695397  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2254  teichoic acid biosynthesis related protein  23.8 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.060696  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0232  teichoic acid biosynthesis related protein  26.4 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422227  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0454  hypothetical protein  25.14 
 
 
343 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0254  teichoic acid biosynthesis related protein  25.85 
 
 
367 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0266168  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3812  glycosyltransferase-distantly-related protein  23.53 
 
 
346 aa  64.7  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0243  teichoic acid biosynthesis related protein  26.12 
 
 
367 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3787  hypothetical protein  25.87 
 
 
351 aa  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0548  hypothetical protein  24.25 
 
 
343 aa  63.2  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1414  hypothetical protein  25.15 
 
 
343 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4031  hypothetical protein  22.88 
 
 
328 aa  60.1  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.510364  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2218  hypothetical protein  25.53 
 
 
347 aa  59.7  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4194  hypothetical protein  23.62 
 
 
346 aa  57.8  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0466  hypothetical protein  24.41 
 
 
351 aa  57  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4072  hypothetical protein  21.74 
 
 
358 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1681  hypothetical protein  25.87 
 
 
347 aa  56.2  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3197  hypothetical protein  23.49 
 
 
346 aa  55.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3546  hypothetical protein  22.25 
 
 
346 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279975  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3720  hypothetical protein  23.06 
 
 
346 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.588173  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0410  hypothetical protein  22.25 
 
 
346 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3289  hypothetical protein  22.38 
 
 
366 aa  53.5  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.60491  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0436  hypothetical protein  23.17 
 
 
346 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.574558  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3367  hypothetical protein  23.42 
 
 
350 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2062  hypothetical protein  21.56 
 
 
362 aa  51.6  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3890  hypothetical protein  22.42 
 
 
346 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877982  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0480  hypothetical protein  21.24 
 
 
349 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0424  hypothetical protein  23.62 
 
 
346 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0450  hypothetical protein  23.89 
 
 
346 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1495  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  23.68 
 
 
363 aa  50.8  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.809197  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3193  hypothetical protein  24.43 
 
 
337 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321046  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0511  hypothetical protein  25.22 
 
 
346 aa  47.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2407  glycosyltransferase  20.06 
 
 
383 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.245126  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1492  hypothetical protein  18.18 
 
 
347 aa  43.9  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286308  normal  0.0796091 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00822  hypothetical protein  20.66 
 
 
348 aa  43.9  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2159  glycosyltransferase family 28 protein  23.82 
 
 
377 aa  43.1  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.188732  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>