20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5589 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5589  putative phage repressor  100 
 
 		 237 aa  489  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4185  hypothetical protein  45.57 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.373535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1912  helix-turn-helix domain protein  29.32 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0655  putative phage repressor  20.92 
 
 		 277 aa  53.9  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.119193  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  25.53 
 
 		 259 aa  52  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2075  putative phage repressor  24.21 
 
 		 221 aa  48.5  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6868  transcriptional regulator, XRE family  26.79 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815043  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  23.5 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  24.23 
 
 		 233 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  23.32 
 
 		 233 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  33.82 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2000  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 172 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221845  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0868  putative phage repressor  22.13 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000901562  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  26.35 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 229 aa  42.7  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  34.25 
 
 		 216 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1743  putative phage repressor  25.25 
 
 		 235 aa  42.4  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  25.35 
 
 		 235 aa  42  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2803  bacteriophage CI repressor  30.88 
 
 		 155 aa  41.6  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  25.25 
 
 		 210 aa  41.6  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>