15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4185 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4185  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  247  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.373535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5589  putative phage repressor  45.57 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2803  bacteriophage CI repressor  38.1 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1673  hypothetical protein  35.79 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1708  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 231 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0192115  normal  0.600335 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2000  transcriptional regulator, XRE family  29.85 
 
 		 172 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221845  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0134  transcriptional regulator, XRE family  28.89 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000191075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1274  transcriptional regulator, XRE family  28.89 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222413  normal  0.176639 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1827  hypothetical protein  30 
 
 		 230 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.226709  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0270  hypothetical protein  33.82 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5487  hypothetical protein  31.25 
 
 		 269 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1905  HTH_3 family transcriptional regulator protein  34.38 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10438  transcriptional regulator, putative  31.34 
 
 		 147 aa  41.2  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1044  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329411  normal  0.26776 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0655  putative phage repressor  30.38 
 
 		 277 aa  40.4  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.119193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>