18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4270 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4270  hypothetical protein  100 
 
 		 499 aa  996    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.796058 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2768  membrane export protein  29.8 
 
 		 508 aa  239  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4792  hypothetical protein  31.12 
 
 		 472 aa  212  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0246434 
 
 
-
 
NC_002950  PG0133  hypothetical protein  28.15 
 
 		 501 aa  207  4e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0569803 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08851  hypothetical protein  25.35 
 
 		 484 aa  176  8e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227884  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4704  polysaccharide biosynthesis protein  25.4 
 
 		 498 aa  173  7.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318996  normal  0.409753 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1920  polysaccharide biosynthesis protein  25.74 
 
 		 484 aa  143  6e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0707623  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2426  polysaccharide biosynthesis protein  23.4 
 
 		 489 aa  139  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  20.37 
 
 		 489 aa  56.6  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  23.43 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  21.74 
 
 		 499 aa  52  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.86 
 
 		 495 aa  50.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 495 aa  47.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 		 494 aa  47  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 461 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  32.89 
 
 		 490 aa  45.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  20.74 
 
 		 434 aa  44.3  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1251  polysaccharide biosynthesis protein  26.5 
 
 		 512 aa  44.3  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0936834  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>