15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3866 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3866  hypothetical protein  100 
 
 		 535 aa  1083    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.991992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4605  hypothetical protein  70.17 
 
 		 571 aa  776    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.723744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3849  Parallel beta-helix repeat protein  42.91 
 
 		 526 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4326  hypothetical protein  34.82 
 
 		 511 aa  226  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  29.06 
 
 		 1771 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2615  hypothetical protein  27.35 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3463  parallel beta-helix repeat protein  27.68 
 
 		 465 aa  77.8  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2252  hypothetical protein  27.05 
 
 		 695 aa  73.6  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5860  hypothetical protein  26.79 
 
 		 451 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal  0.516752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2487  parallel beta-helix repeat protein  25.55 
 
 		 462 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.67625 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  30.9 
 
 		 1755 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2650  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1194 aa  47  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  45.1 
 
 		 852 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0455  pectate lyase-related protein  24.66 
 
 		 563 aa  45.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  25.52 
 
 		 665 aa  43.5  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>