More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0734 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0734  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
157 aa  327  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2320  Ferritin, Dps family protein  49.68 
 
 
157 aa  166  9e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1406  Ferritin Dps family protein  49.02 
 
 
179 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  49.02 
 
 
179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0943  ferritin Dps family protein  47.71 
 
 
169 aa  155  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2338  Ferritin Dps family protein  45.81 
 
 
175 aa  155  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.301965 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2466  Ferritin, Dps family protein  45.16 
 
 
175 aa  154  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  45.75 
 
 
179 aa  154  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0319  Ferritin Dps family protein  49.36 
 
 
157 aa  152  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2076  starvation-inducible DNA-binding protein  48.37 
 
 
151 aa  150  8.999999999999999e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602156  normal  0.30115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2149  Ferritin Dps family protein  45.81 
 
 
158 aa  140  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000025192  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2946  Ferritin Dps family protein  41.67 
 
 
156 aa  130  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4325  Ferritin Dps family protein  42.14 
 
 
157 aa  124  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  46.04 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4105  Ferritin Dps family protein  39.1 
 
 
158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  39.1 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  39.1 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  40.52 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0981  Ferritin, Dps family protein  38.31 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0902637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1046  Ferritin, Dps family protein  38.31 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.609194  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0985  Ferritin, Dps family protein  38.31 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.890442  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1210  DNA-binding stress protein, putative  39.1 
 
 
157 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  40.52 
 
 
163 aa  111  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4208  Ferritin Dps family protein  39.1 
 
 
157 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.857368  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2511  Ferritin Dps family protein  40.88 
 
 
166 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.816956  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1239  Ferritin, Dps family protein  39.1 
 
 
157 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2923  Ferritin Dps family protein  40.88 
 
 
166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  40.38 
 
 
162 aa  111  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3327  Ferritin Dps family protein  37.66 
 
 
155 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.818415  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1158  Dps family protein  38.31 
 
 
155 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3463  Ferritin Dps family protein  37.66 
 
 
155 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1082  Ferritin Dps family protein  37.66 
 
 
155 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.500393  hitchhiker  0.000284805 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  39.1 
 
 
164 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3285  Ferritin Dps family protein  37.66 
 
 
155 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  39.74 
 
 
162 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2879  Ferritin, Dps family protein  38.22 
 
 
155 aa  110  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  40.38 
 
 
162 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  40.38 
 
 
162 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  39.74 
 
 
162 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  40.38 
 
 
162 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2687  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  42.25 
 
 
166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  38.22 
 
 
161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1852  Ferritin and Dps  37.25 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.206437  normal  0.245818 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4066  Ferritin Dps family protein  38.46 
 
 
158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  39.74 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  39.74 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  39.74 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0333  Ferritin and Dps  39.74 
 
 
158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  39.74 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4005  Ferritin Dps family protein  38.46 
 
 
157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  39.74 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1541  Ferritin, Dps family protein  37.25 
 
 
156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103118  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  39.74 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  39.74 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0665  ferritin and Dps  40.26 
 
 
155 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368678 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0595  Ferritin, Dps family protein  38.46 
 
 
174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1265  Ferritin, Dps family protein  37.58 
 
 
156 aa  107  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.758544  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1620  putative DNA-binding protein, Dps  36.6 
 
 
161 aa  107  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00952275  normal  0.23564 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4414  Ferritin and Dps  38.46 
 
 
156 aa  107  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0174703  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0735  hypothetical protein  38.71 
 
 
180 aa  107  5e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2940  Ferritin and Dps  38.22 
 
 
161 aa  107  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.062386  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0378  Ferritin, Dps family protein  37.18 
 
 
172 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.291476  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  38.31 
 
 
165 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  38.31 
 
 
165 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0369  Ferritin Dps family protein  37.18 
 
 
172 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0735152  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  38.96 
 
 
162 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2788  Ferritin Dps family protein  39.31 
 
 
146 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0475826  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0650  Ferritin Dps family protein  38.06 
 
 
180 aa  105  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3741  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  37.25 
 
 
165 aa  104  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81724  normal  0.0592077 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01577  DNA-binding related protein  39.1 
 
 
181 aa  103  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  39.13 
 
 
157 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3841  Ferritin and Dps  40 
 
 
156 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000127863  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3094  Ferritin Dps family protein  37.91 
 
 
160 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0217734  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0102  Ferritin Dps family protein  39.86 
 
 
156 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2333  Ferritin, Dps family protein  37.68 
 
 
166 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.62856  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0325  Ferritin, Dps family protein  38.46 
 
 
174 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0225857 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0853  Ferritin and Dps  38.71 
 
 
160 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0109  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)-like  37.25 
 
 
168 aa  101  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.123517  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22760  Ferritin, Dps family protein  37.18 
 
 
164 aa  99.8  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.240603  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4546  DNA-binding stress protein  37.58 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.632202  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1840  Ferritin, Dps family protein  38 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51830  DNA-binding stress protein  37.58 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0248589  hitchhiker  0.0024179 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2598  Dps family protein  36.96 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000451482  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2768  Ferritin Dps family protein  37.68 
 
 
165 aa  99.8  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0223754 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1871  general stress protein  37.86 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2013  general stress protein  37.86 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1014  Ferritin Dps family protein  37.68 
 
 
201 aa  98.6  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174002  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5065  Ferritin Dps family protein  35.95 
 
 
188 aa  98.6  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  37.86 
 
 
147 aa  97.8  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4078  Ferritin and Dps  38.85 
 
 
158 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0913  Ferritin and Dps  38.85 
 
 
158 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0256847  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13178  DPS family protein  37.31 
 
 
163 aa  97.4  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0585  Ferritin Dps family protein  36.88 
 
 
146 aa  97.4  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1985  ferritin DPS family DNA-binding protein  36.69 
 
 
168 aa  97.1  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.596457  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2953  Ferritin and Dps  33.99 
 
 
157 aa  97.4  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0195  Ferritin and Dps  33.56 
 
 
173 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3626  Ferritin Dps family protein  37.59 
 
 
146 aa  96.7  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2092  general stress protein  37.14 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.233989  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2047  DNA protection during starvation protein 1  37.14 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00820011 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1841  non-specific DNA-binding protein Dps  37.14 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.150285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>