More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0640 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2832  NAD+ synthetase  61.28 
 
 
686 aa  895    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1045  NAD+ synthetase  52.64 
 
 
658 aa  731    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.700176  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6745  NAD+ synthetase  77.15 
 
 
688 aa  1110    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.960806 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0640  NAD+ synthetase  100 
 
 
700 aa  1448    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0635505 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2417  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  47.22 
 
 
626 aa  622  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.906393  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40885  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  29.44 
 
 
713 aa  270  7e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33475  predicted protein  30.65 
 
 
699 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0672097  normal  0.140019 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45509  predicted protein  28.29 
 
 
723 aa  251  3e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.25219  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02550  NAD+ synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  29.35 
 
 
652 aa  246  9.999999999999999e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08203  glutamine dependent NAD synthetase (Eurofung)  27.22 
 
 
678 aa  201  3.9999999999999996e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0452691 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  26.8 
 
 
564 aa  186  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  26.42 
 
 
573 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1130  NAD synthetase  27.18 
 
 
635 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  27.07 
 
 
576 aa  182  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  25.19 
 
 
566 aa  182  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3426  NAD+ synthetase  24.75 
 
 
647 aa  181  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  25.04 
 
 
566 aa  179  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  25.11 
 
 
538 aa  179  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1314  NAD synthetase  26.88 
 
 
635 aa  179  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  26.81 
 
 
576 aa  178  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  25.8 
 
 
587 aa  177  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  25.83 
 
 
574 aa  174  5.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  25.56 
 
 
567 aa  172  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  24.93 
 
 
539 aa  171  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2312  NAD+ synthetase  26.17 
 
 
571 aa  171  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589478  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0531  NAD synthetase  24.48 
 
 
647 aa  171  6e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  26.4 
 
 
542 aa  169  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2216  NAD synthetase  24.85 
 
 
652 aa  169  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808702  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  26.55 
 
 
542 aa  169  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0325  NAD synthetase  24.16 
 
 
645 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0404544  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1200  NAD synthetase  24.08 
 
 
642 aa  168  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  27.06 
 
 
550 aa  167  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  25.11 
 
 
545 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  24.81 
 
 
540 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  26.54 
 
 
583 aa  165  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  25.26 
 
 
571 aa  166  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  26.31 
 
 
561 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  25.86 
 
 
577 aa  166  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  27 
 
 
554 aa  165  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  26.31 
 
 
561 aa  165  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  25.77 
 
 
571 aa  164  5.0000000000000005e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  27 
 
 
554 aa  164  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  23.52 
 
 
566 aa  164  7e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  24.63 
 
 
539 aa  163  8.000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  25.3 
 
 
575 aa  162  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  26.54 
 
 
545 aa  162  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  24.42 
 
 
538 aa  161  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1409  NAD synthetase  25.99 
 
 
561 aa  160  5e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.48 
 
 
577 aa  160  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  25.34 
 
 
599 aa  159  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  26.42 
 
 
553 aa  159  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  24.92 
 
 
561 aa  159  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3756  NAD+ synthetase  25.5 
 
 
573 aa  158  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1494  NAD+ synthetase  24.7 
 
 
582 aa  157  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0582262  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  24.55 
 
 
540 aa  157  8e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  24.55 
 
 
540 aa  156  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  24.55 
 
 
540 aa  156  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0105  NAD synthetase  27.17 
 
 
574 aa  154  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.1435  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  25.11 
 
 
561 aa  154  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  25.81 
 
 
540 aa  154  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15651  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  24.96 
 
 
576 aa  153  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.873266  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0800  hypothetical protein  25.38 
 
 
536 aa  153  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0771  hypothetical protein  25.04 
 
 
536 aa  153  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  24.21 
 
 
540 aa  151  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  25.95 
 
 
546 aa  151  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  26.55 
 
 
562 aa  150  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  25.15 
 
 
552 aa  150  9e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  25.5 
 
 
561 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  25.94 
 
 
546 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  25.41 
 
 
591 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  25.23 
 
 
545 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  27.12 
 
 
548 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  26.62 
 
 
611 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  25.5 
 
 
561 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  25.53 
 
 
545 aa  148  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  25.84 
 
 
565 aa  148  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  25.37 
 
 
554 aa  148  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  25.79 
 
 
577 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  25.71 
 
 
552 aa  148  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0307  NAD+ synthetase  26.39 
 
 
569 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.770204  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  24.38 
 
 
566 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  26.69 
 
 
567 aa  146  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2169  NAD synthetase  25.59 
 
 
685 aa  146  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0634324  hitchhiker  0.00000227772 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  26.3 
 
 
583 aa  146  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  26.33 
 
 
567 aa  146  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0411  NAD+ synthetase  24.7 
 
 
546 aa  146  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.172115 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  24.96 
 
 
591 aa  146  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0853  NAD synthetase  25.54 
 
 
556 aa  146  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  24.47 
 
 
543 aa  145  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1242  NAD synthetase  26.38 
 
 
566 aa  146  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  27.66 
 
 
598 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1089  NAD synthetase  26.38 
 
 
566 aa  146  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34657  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  26.38 
 
 
566 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  25.71 
 
 
547 aa  145  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2239  NAD synthetase  26.53 
 
 
558 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.572998 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3012  NAD synthetase  26.38 
 
 
566 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0804097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0741  NAD synthetase  26.38 
 
 
566 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.233333  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2272  NAD synthetase  26.38 
 
 
609 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1585  NAD synthetase  26.38 
 
 
609 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2199  NAD synthetase  26.46 
 
 
587 aa  144  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>