More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0568 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0568  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  100 
 
 
647 aa  1347    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591959  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4543  asparagine synthase  25.72 
 
 
622 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0967  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.09 
 
 
676 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4334  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.5 
 
 
645 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969348  decreased coverage  0.00494377 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1216  asparagine synthase  27.55 
 
 
626 aa  117  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.108525  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1194  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.33 
 
 
634 aa  117  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4548  asparagine synthase  24.14 
 
 
751 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84734  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2557  putative asparagine synthetase  27.37 
 
 
626 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.44 
 
 
629 aa  115  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411872  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01303  Asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30 
 
 
632 aa  113  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2057  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.49 
 
 
603 aa  112  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.825399  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2884  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.29 
 
 
646 aa  111  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.77 
 
 
629 aa  111  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3649  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.01 
 
 
664 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2388  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.23 
 
 
627 aa  108  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2657  asparagine synthase  22.54 
 
 
639 aa  108  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0825967  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3533  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.27 
 
 
621 aa  106  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0489  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.8 
 
 
666 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1965  asparagine synthase  26.07 
 
 
624 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.595077  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3272  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.02 
 
 
654 aa  104  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0101  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.4 
 
 
615 aa  103  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1778  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.67 
 
 
629 aa  103  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2829  asparagine synthase  29.74 
 
 
654 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0125  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.54 
 
 
571 aa  102  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1953  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  27.9 
 
 
611 aa  101  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2387  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.19 
 
 
655 aa  101  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2871  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.85 
 
 
678 aa  100  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2466  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.86 
 
 
625 aa  100  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2442  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.22 
 
 
607 aa  99.4  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1505  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.26 
 
 
615 aa  99  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1962  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.3 
 
 
667 aa  99.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.16588  hitchhiker  0.0019144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1247  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.77 
 
 
676 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.465909  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0508  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.47 
 
 
626 aa  98.6  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6500  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.08 
 
 
638 aa  98.2  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0622  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  26.02 
 
 
630 aa  98.2  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0368004 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2055  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.67 
 
 
646 aa  98.2  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0669  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.22 
 
 
641 aa  97.8  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0764  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.66 
 
 
663 aa  97.4  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.181606 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1299  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25.52 
 
 
613 aa  96.7  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00294849  normal  0.177591 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0665  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  24.27 
 
 
623 aa  95.9  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0824019  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0186  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25.73 
 
 
583 aa  95.9  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2519  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.81 
 
 
647 aa  95.9  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.828783  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1081  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.18 
 
 
660 aa  95.9  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2340  asparagine synthase  24.59 
 
 
649 aa  95.9  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.139025 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4592  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.43 
 
 
645 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.65001  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1512  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.25 
 
 
637 aa  95.1  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386079  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1749  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.61 
 
 
656 aa  95.1  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5791  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.26 
 
 
627 aa  95.1  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2826  asparagine synthase  29.43 
 
 
662 aa  94.7  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3677  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  27.17 
 
 
632 aa  94.7  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0138  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.7 
 
 
631 aa  94.7  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0809158  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1053  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.82 
 
 
649 aa  94.4  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000122454  hitchhiker  0.00273706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3584  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.51 
 
 
628 aa  94  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3261  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.94 
 
 
671 aa  94  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.5853  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0140  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.08 
 
 
614 aa  94  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0103295  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4960  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.94 
 
 
598 aa  94  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3386  asparagine synthase  23.77 
 
 
645 aa  94  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.320391  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0742  asparagine synthase family amidotransferase  28.87 
 
 
592 aa  94  9e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1462  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.86 
 
 
630 aa  93.2  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.352758  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5441  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.71 
 
 
656 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.277238  normal  0.0334078 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0690  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.96 
 
 
615 aa  92.4  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1034  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.69 
 
 
614 aa  92.8  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0712  putative asparagine synthetase  25.67 
 
 
626 aa  92.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0050  asparagine synthase  26.9 
 
 
636 aa  92.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0472  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  28.84 
 
 
624 aa  92  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2533  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.99 
 
 
625 aa  92  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0819  asparagine synthase  24.22 
 
 
653 aa  91.7  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5318  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.19 
 
 
657 aa  91.7  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4494  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.78 
 
 
610 aa  90.9  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210127  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10450  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25.83 
 
 
938 aa  90.9  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00957139  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2360  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.76 
 
 
619 aa  90.9  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0446354  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0497  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.7 
 
 
630 aa  90.5  8e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0431896  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0254  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.9 
 
 
622 aa  90.5  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0777  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.75 
 
 
670 aa  90.5  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.159884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0556  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.62 
 
 
613 aa  90.5  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.464828  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1975  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  27.23 
 
 
643 aa  89.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1259  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  24.78 
 
 
615 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0896  asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing]  29.95 
 
 
632 aa  89.4  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2247  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.52 
 
 
656 aa  89.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0918  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.52 
 
 
656 aa  89.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1119  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing  29.95 
 
 
632 aa  89.4  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1004  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.52 
 
 
656 aa  89.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.951042  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1379  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.85 
 
 
620 aa  89.4  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000243161  normal  0.214624 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2121  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.97 
 
 
653 aa  89  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.973734  normal  0.744167 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2864  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.74 
 
 
678 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.113141  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3180  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.97 
 
 
660 aa  89.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1310  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  24.78 
 
 
615 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000179862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1074  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  24.35 
 
 
592 aa  88.6  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139071  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1158  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.52 
 
 
656 aa  89  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.433093  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1535  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.52 
 
 
656 aa  89  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1157  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  24.35 
 
 
592 aa  88.6  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4419  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.09 
 
 
665 aa  88.6  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0959  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.07 
 
 
635 aa  88.6  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1501  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.51 
 
 
614 aa  88.6  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11980  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.5 
 
 
649 aa  88.6  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.658522  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0082  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.52 
 
 
656 aa  89  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.493837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1055  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  24.35 
 
 
592 aa  88.2  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0241  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.45 
 
 
654 aa  88.6  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.148011 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0292  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28 
 
 
639 aa  88.6  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.216365  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1597  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.68 
 
 
640 aa  88.2  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>