17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28460 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_28460  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 245 aa  464  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.373248 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1630  ABC-2 type transporter  58.26 
 
 		 276 aa  227  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.68052  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18060  ABC-2 type transporter  40.52 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.031789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30630  ABC-type multidrug transport system, permease component  48.09 
 
 		 273 aa  168  9e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0589  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0475  ABC-2 type transporter  24.86 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2825  ABC-2 type transporter  31.9 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  36.04 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 375 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4327  ABC-2 type transporter  38.55 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  34.78 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  33.03 
 
 		 275 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3387  multidrug ABC transporter inner membrane protein  29.73 
 
 		 281 aa  42.4  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  21.67 
 
 		 336 aa  42  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.19 
 
 		 264 aa  42  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 		 274 aa  42  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1056  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 270 aa  41.6  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.655499  normal  0.0850571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>