22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_27530 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_27530  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  538  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2892  hypothetical protein  37.69 
 
 		 440 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.001501  normal  0.0367293 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0789  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.34 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2467  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.19 
 
 		 497 aa  105  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102778 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4227  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  34.25 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0939  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.49 
 
 		 399 aa  82.4  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211374  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1768  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.51 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2960  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.77 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0697237  normal  0.577933 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1519  hypothetical protein  36.43 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1183  hypothetical protein  30.37 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8353  hypothetical protein  30.45 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1593  hypothetical protein  31.29 
 
 		 361 aa  63.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3787  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  39.33 
 
 		 426 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499391  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3735  hypothetical protein  30.6 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07610  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  31.37 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.681594  normal  0.51136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7937  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  26.51 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4125  hypothetical protein  29.93 
 
 		 290 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0719  hypothetical protein  26.32 
 
 		 333 aa  51.6  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4116  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.57 
 
 		 350 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  normal  0.872293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1811  hypothetical protein  30.14 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76479  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0935  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.42 
 
 		 368 aa  46.2  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2507  ThiF family protein  23.35 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.720809 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>