29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15210 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_15210  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  100 
 
 		 111 aa  220  7e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2050  anti-sigma-factor antagonist  53.64 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.780099  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0085  anti-sigma-factor antagonist  43.4 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0298  anti-sigma-factor antagonist  47.37 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.224332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0122  anti-sigma-factor antagonist  38.55 
 
 		 116 aa  67  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01250  anti-anti-sigma factor  38.95 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4123  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0557  anti-sigma-factor antagonist  40.2 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4532  anti-sigma-factor antagonist  33.72 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339774  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  35.56 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  32.98 
 
 		 117 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2907  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.67 
 
 		 111 aa  47.4  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1429  anti-sigma factor antagonist  34.94 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.52338  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  30.34 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2967  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.216635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  29.89 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3639  anti-sigma-factor antagonist  37.04 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  36.14 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5145  anti-sigma-factor antagonist  32.29 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117847  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  29.07 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0557  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.102559  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  23.33 
 
 		 101 aa  42  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  31.87 
 
 		 375 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4854  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4116  anti-sigma-factor antagonist  31.07 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  34.44 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35230  STAS domain-containing protein  28.38 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  28.09 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>