195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09060 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_09060  transcription factor WhiB  100 
 
 		 111 aa  225  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.039305  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2549  transcription factor WhiB  73 
 
 		 108 aa  143  9e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2347  transcription factor WhiB  71.29 
 
 		 108 aa  141  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00874285  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1861  transcription factor WhiB  69.7 
 
 		 109 aa  141  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.254853  hitchhiker  0.00875656 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1411  transcription factor WhiB  81.48 
 
 		 84 aa  135  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  66.67 
 
 		 103 aa  135  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  75.58 
 
 		 95 aa  135  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6331  transcription factor WhiB  67.35 
 
 		 102 aa  134  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0016166  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4070  transcription factor WhiB  77.38 
 
 		 87 aa  133  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0751  transcription factor WhiB  89.86 
 
 		 85 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.393905  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  74.71 
 
 		 97 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  71.91 
 
 		 123 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  77.33 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  76.62 
 
 		 92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31070  transcription factor WhiB  68.54 
 
 		 95 aa  126  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  0.666972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1325  transcription factor WhiB  84.85 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19841  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20790  transcription factor WhiB  82.19 
 
 		 99 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.116368  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1342  transcription factor WhiB  84.85 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1361  transcription factor WhiB  84.85 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373176  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3850  transcription factor WhiB  85.29 
 
 		 155 aa  124  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146989  normal  0.0930032 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1184  transcription factor WhiB  81.16 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1734  transcription factor WhiB  79.71 
 
 		 133 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4729  transcription factor WhiB  79.71 
 
 		 133 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08530  transcription factor WhiB  88.89 
 
 		 88 aa  121  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.590298 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1263  transcription factor WhiB  65.49 
 
 		 177 aa  120  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1192  transcription factor WhiB  69.15 
 
 		 181 aa  117  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0679165  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1382  transcription factor WhiB  91.38 
 
 		 86 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  85.96 
 
 		 210 aa  114  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5864  transcription factor WhiB  72.73 
 
 		 213 aa  114  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507295  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4662  transcriptional regulatory protein WhiB-like WhiB2  68.49 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.160816 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1206  transcription factor WhiB  75.71 
 
 		 105 aa  110  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.56216 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4303  transcription factor WhiB  84.21 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.956694  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0457  transcription factor WhiB  66.67 
 
 		 106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0947  transcription factor WhiB  80.7 
 
 		 85 aa  105  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05270  Transcription factor WhiB  57.89 
 
 		 176 aa  103  8e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463527  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0761  hypothetical protein  61.64 
 
 		 99 aa  101  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000133988  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2403  transcription factor WhiB  76.67 
 
 		 110 aa  100  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.715181  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0317  transcription factor WhiB  53.19 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1766  transcription factor WhiB  53.73 
 
 		 80 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  54.05 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3459  transcription factor WhiB  66.67 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08190  transcription factor WhiB  52.7 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  52.7 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5308  transcription factor WhiB  49.25 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538653  normal  0.906858 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0566  transcription factor WhiB  47.69 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0971  transcription factor WhiB  52.05 
 
 		 82 aa  70.5  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.616847 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1713  transcription factor WhiB  50 
 
 		 83 aa  70.1  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3759  transcription factor WhiB  51.39 
 
 		 82 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1057  transcription factor WhiB  50.75 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20500  transcription factor WhiB  50 
 
 		 82 aa  69.3  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.490693  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  48.65 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  50 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0328  transcription factor WhiB  45.31 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4184  transcription factor WhiB  51.35 
 
 		 83 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1383  transcription factor WhiB  47.22 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1401  transcription factor WhiB  47.22 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1417  transcription factor WhiB  47.22 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  47.22 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1782  transcription factor WhiB  47.22 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554271  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2396  transcription factor WhiB  50 
 
 		 82 aa  67.8  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.483285  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13245  transcriptional regulatory protein whib-like whiB1  45.83 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13712  transcriptional regulatory protein whib-like whiB4  39.76 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0618249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1412  transcription factor WhiB  48.57 
 
 		 83 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4824  transcription factor WhiB  40.96 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4910  transcription factor WhiB  40.96 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695176  normal  0.54067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5441  transcription factor WhiB  42.11 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331052 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5211  transcription factor WhiB  40.96 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000534412 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3716  transcription factor WhiB  43.08 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5161  transcription factor WhiB  49.32 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0236  transcription factor WhiB  46.27 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512712  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4081  transcription factor WhiB  43.84 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3521  transcription factor WhiB  45.71 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1110  transcription factor WhiB  45.71 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126652  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30700  transcription factor WhiB  48.61 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.588059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8306  transcription factor WhiB  47.14 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0833  transcription factor WhiB  49.23 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1366  transcription factor WhiB  43.66 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.460048 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3701  transcription factor WhiB  43.06 
 
 		 85 aa  63.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.853386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0428  transcription factor WhiB  43.28 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1883  putative regulatory protein  45.59 
 
 		 99 aa  62  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6686  hypothetical protein  46.97 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.429738  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4097  transcription factor WhiB  40 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1741  transcription factor WhiB  37.18 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0449249  normal  0.98439 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3695  transcription factor WhiB  47.22 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2241  transcription factor WhiB  45.45 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.105854 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2805  transcription factor WhiB  44.12 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188246  normal  0.210828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  44.12 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1816  transcription factor WhiB  45.07 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5211  transcription factor WhiB  41.89 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198734  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5494  transcription factor WhiB  44.12 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0552744  normal  0.028254 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07590  Transcription factor WhiB  47.37 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.882581  normal  0.470516 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2326  transcription factor WhiB  46.15 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0196  transcription factor WhiB  43.33 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.838219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1877  transcription factor WhiB  46.15 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0694985  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3795  transcription factor WhiB  46.15 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.335539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2828  transcription factor WhiB  44.62 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.506614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7711  transcription factor WhiB  44.62 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4922  transcription factor WhiB  43.33 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3938  transcription factor WhiB  38.67 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.593836  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0299  regulatory protein  43.66 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>