25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3608 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3608  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  461  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0335  hypothetical protein  94.26 
 
 		 287 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.871928  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3805  hypothetical protein  91.39 
 
 		 272 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0366  hypothetical protein  87.08 
 
 		 272 aa  392  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3626  hypothetical protein  87.14 
 
 		 277 aa  389  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3844  hypothetical protein  63.27 
 
 		 260 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4926  hypothetical protein  63 
 
 		 251 aa  309  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000829023 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4507  hypothetical protein  66.97 
 
 		 255 aa  307  6.999999999999999e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0358  hypothetical protein  57.31 
 
 		 305 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0360  hypothetical protein  56.13 
 
 		 305 aa  299  3e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0365  hypothetical protein  54.72 
 
 		 272 aa  296  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0368  hypothetical protein  56.52 
 
 		 323 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000028153 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3425  hypothetical protein  63 
 
 		 236 aa  295  5e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3861  hypothetical protein  62.67 
 
 		 229 aa  276  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.248681  unclonable  0.00000280431 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2047  hypothetical protein  60.19 
 
 		 213 aa  275  3e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2241  hypothetical protein  58.85 
 
 		 223 aa  272  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0273  hypothetical protein  54.91 
 
 		 231 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1657  hypothetical protein  37.62 
 
 		 211 aa  161  7e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12342  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1501  hypothetical protein  33.66 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0508793  hitchhiker  0.000844236 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2445  hypothetical protein  25.26 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2393  hypothetical protein  25.79 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3844  hypothetical protein  24.88 
 
 		 524 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0476944 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0044  hypothetical protein  23.66 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1833  hypothetical protein  22.73 
 
 		 476 aa  45.4  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  24.32 
 
 		 442 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>