27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2241 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2241  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  266  5e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000626898  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2858  hypothetical protein  68.99 
 
 		 181 aa  160  6e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000291416 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1502  hypothetical protein  63.95 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.387853  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1304  hypothetical protein  63.35 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.281387  normal  0.0615794 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2260  hypothetical protein  57.82 
 
 		 143 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00464022  normal  0.48524 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2696  hypothetical protein  55.1 
 
 		 142 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2580  hypothetical protein  54.42 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0433297  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2621  hypothetical protein  54.42 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00231504  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1763  hypothetical protein  54.42 
 
 		 143 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00142931  hitchhiker  0.00932404 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2007  hypothetical protein  57.14 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2332  hypothetical protein  52.67 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00550245  hitchhiker  0.00911187 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2451  hypothetical protein  64.76 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0669887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2387  hypothetical protein  50.79 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000879292  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2308  hypothetical protein  69.35 
 
 		 136 aa  87.4  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0781022  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1787  hypothetical protein  75 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000888061 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3152  hypothetical protein  41.96 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2413  hypothetical protein  61.29 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0124619  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21570  hypothetical protein  38.97 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1836  hypothetical protein  37.12 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01093  hypothetical protein  48.08 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.183403  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2636  hypothetical protein  37.38 
 
 		 117 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.82206  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1553  hypothetical protein  43.1 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320055 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0290  hypothetical protein  44.23 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2002  hypothetical protein  45.21 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1100  hypothetical protein  34.26 
 
 		 377 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.303009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3095  hypothetical protein  41.49 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2853  hypothetical protein  44.21 
 
 		 173 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652841  normal  0.16836 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>