44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1029 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1029  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  312  8e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14565  normal  0.606102 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0124  hypothetical protein  56.85 
 
 		 146 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2773  hypothetical protein  57.64 
 
 		 146 aa  172  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000099126  unclonable  0.000000140227 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1743  protein of unknown function DUF1130  59.09 
 
 		 144 aa  164  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0781  hypothetical protein  48.65 
 
 		 153 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.588126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4463  hypothetical protein  47.97 
 
 		 153 aa  157  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0955  hypothetical protein  48.28 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1282  hypothetical protein  40 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00265789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1109  hypothetical protein  28.95 
 
 		 298 aa  57  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.137011  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0586  hypothetical protein  30.99 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.794259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5517  hypothetical protein  33.08 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0127  hypothetical protein  25.87 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4240  hypothetical protein  31.58 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0072533  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2197  hypothetical protein  26.85 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0304  hypothetical protein  28.57 
 
 		 297 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352095  normal  0.186853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3400  hypothetical protein  28.14 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000709741  normal  0.10054 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1643  hypothetical protein  26.57 
 
 		 154 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.512897  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0130  hypothetical protein  33.09 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3912  hypothetical protein  27.52 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1898  hypothetical protein  31.58 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0934802  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4268  protein of unknown function DUF1130  32.33 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5361  hypothetical protein  28.57 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0891  hypothetical protein  29.58 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0714712  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1798  hypothetical protein  27.61 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000938448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2843  hypothetical protein  23.87 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000164273  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5300  hypothetical protein  28.78 
 
 		 166 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118609 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3900  hypothetical protein  33.08 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900559  normal  0.203782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0922  hypothetical protein  28.03 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6081  protein of unknown function DUF1130  28.47 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0251  hypothetical protein  26.09 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.726286  normal  0.319712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4371  protein of unknown function DUF1130  30.08 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201417 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4723  protein of unknown function DUF1130  28.68 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264076  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0516  hypothetical protein  24.83 
 
 		 176 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597563  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2660  protein of unknown function DUF1130  28.17 
 
 		 177 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0629  protein of unknown function DUF1130  26.97 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0956  hypothetical protein  25 
 
 		 198 aa  43.5  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.98733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0773  protein of unknown function DUF1130  25.97 
 
 		 294 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0457  hypothetical protein  26.24 
 
 		 351 aa  41.6  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4004  hypothetical protein  24.83 
 
 		 182 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1876  hypothetical protein  27.54 
 
 		 191 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3491  hypothetical protein  26.28 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2844  protein of unknown function DUF1130  26.75 
 
 		 199 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000271396  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2541  hypothetical protein  25.32 
 
 		 195 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3713  hypothetical protein  25.33 
 
 		 185 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251744  normal  0.149746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>