35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0595 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0614  Ig domain-containing protein  89.33 
 
 
980 aa  1734    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0627  Ig domain protein group 1 domain protein  90.22 
 
 
979 aa  1771    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0618  Ig domain protein group 1 domain protein  89.84 
 
 
980 aa  1764    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0622  Ig domain-containing protein  100 
 
 
974 aa  2006    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.152382 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0595  Ig domain-containing protein  100 
 
 
974 aa  2006    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0587  Ig domain-containing protein  90.14 
 
 
980 aa  1770    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0591  hypothetical protein  32.29 
 
 
1010 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0615  Ig domain-containing protein  28.6 
 
 
968 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0498521  normal  0.318531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0619  Ig domain protein group 1 domain protein  28.6 
 
 
968 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0588  Ig domain-containing protein  28.72 
 
 
968 aa  283  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4398  Ig domain-containing protein  62.64 
 
 
1316 aa  184  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0506972  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0628  hypothetical protein  58.14 
 
 
216 aa  101  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.831123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0600  hypothetical protein  58.14 
 
 
216 aa  101  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01641  hypothetical protein  25.14 
 
 
896 aa  87  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05976  hypothetical protein  29.55 
 
 
850 aa  86.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  41.24 
 
 
2933 aa  65.9  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05990  hypothetical protein  25.93 
 
 
857 aa  65.1  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05832  peptidase  26.12 
 
 
847 aa  63.5  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  31.91 
 
 
4953 aa  63.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  40.45 
 
 
1050 aa  61.6  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  29.31 
 
 
5337 aa  61.6  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  40.45 
 
 
1075 aa  61.2  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  40.45 
 
 
1075 aa  61.2  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2711  hypothetical protein  27.86 
 
 
965 aa  61.2  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  41.38 
 
 
2933 aa  54.3  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  35.19 
 
 
1417 aa  53.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  34.46 
 
 
1417 aa  52.8  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2429  invasin region 3  38.64 
 
 
969 aa  52.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.621215  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2329  invasin  38.64 
 
 
941 aa  52.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.942783  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1994  invasin domain-containing protein  37.5 
 
 
690 aa  49.3  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  33.88 
 
 
1418 aa  48.1  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  34.82 
 
 
1084 aa  47.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  34.26 
 
 
1396 aa  46.2  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  33.33 
 
 
1417 aa  46.2  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  30.18 
 
 
1746 aa  46.2  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>