More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0516 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0516  fumarate hydratase, class II  100 
 
 		 467 aa  968    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0537  fumarate hydratase, class II  98.5 
 
 		 467 aa  955    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0542  fumarate hydratase, class II  97.86 
 
 		 467 aa  931    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0160  fumarate hydratase, class II  72.23 
 
 		 465 aa  687    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0598  fumarate hydratase, class II  95.71 
 
 		 467 aa  908    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3801  fumarate hydratase, class II  97.22 
 
 		 467 aa  922    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0904  fumarate hydratase, class II  68.76 
 
 		 465 aa  632  1e-180  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1189  fumarate hydratase, class II  67.25 
 
 		 466 aa  633  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0238  fumarate hydratase, class II  64.29 
 
 		 466 aa  629  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  65.65 
 
 		 464 aa  630  1e-179  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  66.01 
 
 		 462 aa  624  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2816  fumarate hydratase, class II  65.15 
 
 		 467 aa  620  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2694  fumarate hydratase, class II  63.42 
 
 		 466 aa  617  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.650126  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09838  FumC  63.62 
 
 		 465 aa  607  9.999999999999999e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2054  fumarate hydratase  62.83 
 
 		 465 aa  587  1e-166  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1185  fumarate hydratase, class II  62.91 
 
 		 462 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4786  fumarate hydratase  62.83 
 
 		 461 aa  577  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.183697  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  60.99 
 
 		 464 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  60.99 
 
 		 464 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  60.99 
 
 		 464 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  60.34 
 
 		 464 aa  568  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  59.78 
 
 		 462 aa  568  1e-161  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  60.56 
 
 		 464 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  60.56 
 
 		 464 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  62.31 
 
 		 471 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  60.26 
 
 		 459 aa  565  1e-160  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  60.78 
 
 		 464 aa  566  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  60.26 
 
 		 459 aa  567  1e-160  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  60.34 
 
 		 464 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  60.34 
 
 		 464 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  61.34 
 
 		 464 aa  563  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  60.34 
 
 		 464 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  60.34 
 
 		 464 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  60.13 
 
 		 631 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  60.34 
 
 		 464 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  61.52 
 
 		 464 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  61.52 
 
 		 464 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  61.04 
 
 		 463 aa  559  1e-158  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  58.96 
 
 		 467 aa  559  1e-158  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  58.96 
 
 		 467 aa  558  1e-158  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  60.34 
 
 		 464 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0795  fumarate hydratase, class II  60.57 
 
 		 476 aa  558  1e-158  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  59.69 
 
 		 467 aa  556  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2213  fumarate hydratase  60.99 
 
 		 464 aa  554  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.620267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  60.35 
 
 		 465 aa  553  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  60.13 
 
 		 467 aa  549  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  59.48 
 
 		 465 aa  548  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  58.61 
 
 		 467 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  59.91 
 
 		 467 aa  546  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  59.26 
 
 		 461 aa  546  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  59.48 
 
 		 465 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  59.91 
 
 		 467 aa  546  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  58.61 
 
 		 467 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  58.61 
 
 		 467 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  59 
 
 		 462 aa  547  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  58.61 
 
 		 467 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  59.26 
 
 		 465 aa  545  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  59.91 
 
 		 467 aa  546  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  58.61 
 
 		 467 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  59.69 
 
 		 467 aa  543  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1589  fumarate hydratase  59.69 
 
 		 467 aa  543  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.194502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  59.69 
 
 		 467 aa  543  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  59.04 
 
 		 465 aa  543  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  59.69 
 
 		 467 aa  544  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  57.73 
 
 		 461 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  57.73 
 
 		 461 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0285  fumarate hydratase  57.54 
 
 		 463 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  59.69 
 
 		 465 aa  541  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  59.26 
 
 		 470 aa  538  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  58.04 
 
 		 463 aa  538  9.999999999999999e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0424  fumarate hydratase  57.36 
 
 		 463 aa  538  9.999999999999999e-153  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  58.61 
 
 		 465 aa  541  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1556  fumarate hydratase  57.11 
 
 		 463 aa  536  1e-151  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433937  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1366  fumarate hydratase  57.11 
 
 		 463 aa  538  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.862526  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  59.05 
 
 		 510 aa  535  1e-151  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1038  fumarate hydratase  60.56 
 
 		 466 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  57.54 
 
 		 466 aa  536  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  57.83 
 
 		 464 aa  535  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  58.35 
 
 		 465 aa  537  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  58.1 
 
 		 464 aa  533  1e-150  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  58.62 
 
 		 467 aa  534  1e-150  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  60.39 
 
 		 466 aa  534  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  58.73 
 
 		 463 aa  534  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  58.7 
 
 		 468 aa  530  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  57.7 
 
 		 492 aa  530  1e-149  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.595402 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1049  fumarate hydratase  56.49 
 
 		 463 aa  530  1e-149  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.62891  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  57.73 
 
 		 463 aa  530  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  59.04 
 
 		 474 aa  530  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  56.28 
 
 		 469 aa  525  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  56.65 
 
 		 465 aa  526  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1637  fumarate hydratase  55.84 
 
 		 462 aa  522  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156374  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  55.84 
 
 		 462 aa  523  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  55.84 
 
 		 462 aa  523  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  55.84 
 
 		 462 aa  524  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1795  fumarate hydratase, class II  56.37 
 
 		 465 aa  521  1e-147  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  56.71 
 
 		 462 aa  522  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1767  fumarate hydratase  55.84 
 
 		 462 aa  522  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1939  fumarate hydratase  54.78 
 
 		 461 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1007  fumarate hydratase  57.21 
 
 		 463 aa  521  1e-147  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0281395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  56.06 
 
 		 462 aa  524  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>