38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_24430 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_24430  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  661    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28300  hypothetical protein  54.1 
 
 
365 aa  280  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.197043 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0230  hypothetical protein  24.66 
 
 
290 aa  60.8  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00383338  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1131  hypothetical protein  23.47 
 
 
298 aa  59.3  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0142  hypothetical protein  22.73 
 
 
298 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.836251  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2384  hypothetical protein  24.91 
 
 
325 aa  56.2  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000252943  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1931  hypothetical protein  24.24 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1947  hypothetical protein  24.01 
 
 
299 aa  53.9  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000247154  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1941  hypothetical protein  23.64 
 
 
288 aa  53.5  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000016272  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0807  hypothetical protein  24.05 
 
 
298 aa  52  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.098381  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0058  hypothetical protein  22.16 
 
 
315 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00639651  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2384  hypothetical protein  23.25 
 
 
314 aa  51.2  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000288219  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1737  hypothetical protein  25.44 
 
 
318 aa  49.7  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033036 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0216  hypothetical protein  28.12 
 
 
312 aa  49.7  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115501  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2565  hypothetical protein  21.8 
 
 
313 aa  49.3  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136363  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4940  hypothetical protein  20.99 
 
 
327 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0958  hypothetical protein  23.43 
 
 
285 aa  47  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5077  hypothetical protein  21.58 
 
 
325 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4715  hypothetical protein  21.58 
 
 
331 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0294  hypothetical protein  20.92 
 
 
315 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1091  hypothetical protein  22.78 
 
 
322 aa  47  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0528026  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1070  hypothetical protein  23.59 
 
 
287 aa  46.2  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5306  hypothetical protein  21.88 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939469  normal  0.0565222 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1487  hypothetical protein  21.22 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0898  hypothetical protein  24.47 
 
 
283 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148019 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  21.86 
 
 
306 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0101  hypothetical protein  28 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2719  hypothetical protein  23.79 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0669  hypothetical protein  24.82 
 
 
292 aa  45.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4711  hypothetical protein  22.48 
 
 
293 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0013874  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2583  hypothetical protein  20.42 
 
 
317 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.21441e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1178  hypothetical protein  22.92 
 
 
314 aa  43.9  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0886  transposase and inactivated derivative  25.25 
 
 
310 aa  43.1  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615238  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0049  hypothetical protein  23.19 
 
 
296 aa  43.1  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1261  hypothetical protein  23.41 
 
 
290 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4555  hypothetical protein  22.36 
 
 
234 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.166025  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1763  hypothetical protein  27.78 
 
 
300 aa  43.1  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0148846 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0403  hypothetical protein  26.19 
 
 
284 aa  42.4  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000003324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>