82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_21450 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_21450  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  100 
 
 		 72 aa  137  4.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12100  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  86.11 
 
 		 72 aa  97.1  8e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1040  H+transporting two-sector ATPase C subunit  63.38 
 
 		 72 aa  89.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0572773 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4141  ATP synthase F0, C subunit  64.41 
 
 		 75 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  62.71 
 
 		 74 aa  64.3  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2121  ATP synthase F0, C subunit  56.67 
 
 		 76 aa  64.3  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306231  hitchhiker  0.00429019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  49.33 
 
 		 77 aa  62  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  55.17 
 
 		 75 aa  62  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  54.84 
 
 		 73 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  49.33 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  53.23 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  49.28 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3635  ATP synthase F0, C subunit  47.14 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4017  H+transporting two-sector ATPase C subunit  52.54 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  45.9 
 
 		 69 aa  57  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  53.23 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18250  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  47.62 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.447558  normal  0.275896 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  45.76 
 
 		 70 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  45.76 
 
 		 70 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  45.76 
 
 		 70 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08130  ATP synthase subunit C  46.03 
 
 		 71 aa  51.6  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  47.54 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  45.76 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  45.76 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  45.76 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  45.76 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  45.76 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  45.76 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  45.76 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  45.76 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  45.76 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  45.76 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  45.76 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0895  H+transporting two-sector ATPase C subunit  49.15 
 
 		 74 aa  50.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  41.1 
 
 		 82 aa  50.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  41.1 
 
 		 82 aa  50.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  41.1 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 		 111 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1019  H+transporting two-sector ATPase C subunit  49.15 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  38.36 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0143  putative F0F1 ATP synthase subunit C  35.53 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  38.36 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  38.36 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  38.36 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  45.28 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  41.51 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  46.94 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4245  F0F1 ATP synthase subunit C  40.54 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000128569  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0428  F0F1 ATP synthase subunit C  43.28 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  44.68 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  46.27 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  39.13 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4378  H+transporting two-sector ATPase C subunit  43.75 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  42.31 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  42.31 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  43.4 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  40.68 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  43.4 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2603  ATP synthase F0, C subunit  40.38 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239607  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3961  F0F1 ATP synthase subunit C  39.19 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.418687  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  43.4 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0515  F0F1 ATP synthase subunit C  46 
 
 		 65 aa  42  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000303287  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0078  ATP synthase F0, C subunit  41.67 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  43.4 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  43.33 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1800  ATP synthase F0, C subunit  56.14 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.217172  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4300  F0F1 ATP synthase subunit C  43.14 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00293753  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  38.89 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3245  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  42.42 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2343  H+transporting two-sector ATPase C subunit  47.62 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000577712 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  39.29 
 
 		 321 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2610  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  47.62 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.258859  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2255  ATP synthase F0, C subunit  39.22 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.139541  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3064  F0F1 ATP synthase subunit C  37.68 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  34.92 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2523  F0F1 ATP synthase subunit C  36.23 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000405757  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  40.38 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29600  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  48.78 
 
 		 82 aa  40  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>