46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06860 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_06860  DMSO reductase anchor subunit  100 
 
 		 288 aa  565  1e-160  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.139777 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2790  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  44.29 
 
 		 284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0145436 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0466  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  38.31 
 
 		 292 aa  135  6.0000000000000005e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24580  DMSO reductase anchor subunit  36.57 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0426  putative dimethyl sulfoxide reductase anchor subunit  39.27 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.905194  hitchhiker  0.00000175345 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00530  DMSO reductase anchor subunit  31.7 
 
 		 350 aa  95.1  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2253  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  31.03 
 
 		 286 aa  92.8  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.285231  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00510  DMSO reductase anchor subunit  32.57 
 
 		 287 aa  87  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3392  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  32.7 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0920  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain C  32.7 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.809419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3259  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  33.54 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1607  dmso reductase anchor subunit  28.65 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00900  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit C  29.39 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.123294  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1843  dmso reductase anchor subunit  28.65 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.882429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00907  hypothetical protein  29.39 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.115308  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02505  hypothetical protein  27.01 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1689  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  27.15 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0746368 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1598  dmso reductase anchor subunit  28.65 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448472  normal  0.971647 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1666  dmso reductase anchor subunit  28.65 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1676  dmso reductase anchor subunit  28.65 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.088493  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0972  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  28.81 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1058  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  28.81 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1420  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  28.14 
 
 		 287 aa  67  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1610  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  28.05 
 
 		 284 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1797  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  28.05 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2224  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  28.81 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.83571 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01549  hypothetical protein  28.05 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01559  oxidoreductase, membrane subunit  28.05 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2040  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  28.05 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2053  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  28.05 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.572906  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1663  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  28.05 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2432  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  29.39 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2700  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  29.39 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1001  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  29.39 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2747  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  29.39 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72302  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2299  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  27.44 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149119 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1776  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  27.61 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1031  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  29.69 
 
 		 287 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1000  dmso reductase anchor subunit  29.69 
 
 		 287 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1080  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  29.69 
 
 		 287 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1065  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  29.69 
 
 		 287 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000142523  normal  0.658942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0971  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  32.3 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1454  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  29.41 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2718  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  29.41 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1342  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  29.41 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0456  hypothetical protein  28.25 
 
 		 315 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>