37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02790 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_02790  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  644    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.874218  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2113  Repeat of unknown function XGLTT  28.32 
 
 
462 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2043  XGLTT repeat protein  28.36 
 
 
437 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0371  IcmE  20.45 
 
 
1039 aa  73.2  0.000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1811  IcmE protein  20.45 
 
 
1034 aa  72.8  0.000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0696  putative copper-resistance protein CopB  32.73 
 
 
384 aa  63.9  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000706782  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8091  hypothetical protein  26.67 
 
 
450 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.623212  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1817  hypothetical protein  23.42 
 
 
486 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5862  hypothetical protein  30.7 
 
 
438 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310924  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0517  hypothetical protein  22.51 
 
 
1048 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0493  hypothetical protein  22.51 
 
 
1048 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  27.18 
 
 
479 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  20.71 
 
 
1191 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2900  hypothetical protein  22.91 
 
 
793 aa  50.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.366877  normal  0.180357 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0033  FHA domain containing protein  29.55 
 
 
428 aa  49.7  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  25.71 
 
 
645 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0024  hypothetical protein  24.52 
 
 
340 aa  48.9  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3133  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  32.05 
 
 
104 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal  0.206734 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03729  1,3-beta-D-glucan synthase catalytic subunitPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92225]  32.91 
 
 
1905 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.789919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  24.87 
 
 
263 aa  46.6  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00420  hypothetical protein  28.38 
 
 
438 aa  46.6  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0052  hypothetical protein  57.14 
 
 
1142 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0310  pentapeptide MXKDX repeat protein  22.22 
 
 
109 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109825  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0298  pentapeptide MXKDX repeat protein  22.22 
 
 
109 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.62 
 
 
14916 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13180  PPE family protein  25.2 
 
 
590 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.78339e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11157  PPE family protein  27.16 
 
 
636 aa  44.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.38215e-17  normal  0.405765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.69 
 
 
810 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  24.92 
 
 
582 aa  43.5  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  0.0000000713233 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1688  CAIB/BAIF family CoA transferase  25.41 
 
 
472 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1776  CAIB/BAIF family CoA transferase  25.41 
 
 
472 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0104  CAIB/BAIF family CoA transferase  25.41 
 
 
472 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0257  CAIB/BAIF family CoA transferase  25.41 
 
 
472 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  23.49 
 
 
213 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0320  CAIB/BAIF family CoA transferase  25.41 
 
 
472 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1105  CAIB/BAIF family CoA transferase  25.41 
 
 
472 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.287357  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1273  CAIB/BAIF family CoA transferase  25.41 
 
 
472 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>