38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3133 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3133  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  100 
 
 		 104 aa  184  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal  0.206734 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0298  pentapeptide MXKDX repeat protein  64.42 
 
 		 109 aa  115  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0310  pentapeptide MXKDX repeat protein  64.42 
 
 		 109 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0540  hypothetical protein  62.63 
 
 		 93 aa  100  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2593  hypothetical protein  61.7 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1511  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  57.94 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.144611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2991  pentapeptide MXKDX repeat protein  58.65 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272043  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2530  hypothetical protein  54.17 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.234183 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1517  hypothetical protein  49.04 
 
 		 86 aa  73.6  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2731  hypothetical protein  47.12 
 
 		 83 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2814  pentapeptide MXKDX repeat protein  49.45 
 
 		 79 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.873208  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2570  pentapeptide MXKDX repeat protein  48.08 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2179  hypothetical protein  58.97 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.565445 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2538  hypothetical protein  74 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2931  hypothetical protein  67.8 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2752  pentapeptide MXKDX repeat protein  33.7 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4332  hypothetical protein  49.37 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.834965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2843  hypothetical protein  53.85 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0198  hypothetical protein  47.62 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1196  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  49.49 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0762518  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0483  hypothetical protein  45 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1402  hypothetical protein  45 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.386495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1397  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  45 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0669  hypothetical protein  45 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.664868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1198  hypothetical protein  45 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0725407  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1530  hypothetical protein  45.26 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1698  pentapeptide MXKDX repeat protein  40.26 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4053  hypothetical protein  47.25 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5021  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  49.33 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978776  normal  0.0965687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2665  pentapeptide MXKDX repeat protein  63.83 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1106  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  53.42 
 
 		 83 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4814  pentapeptide MXKDX repeat protein  40.43 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.901496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1106  hypothetical protein  53.42 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227161  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0621  hypothetical protein  46.08 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02790  hypothetical protein  32.89 
 
 		 349 aa  45.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.874218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3034  hypothetical protein  30.36 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.857374 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1200  pentapeptide MXKDX repeat protein  46 
 
 		 74 aa  40.8  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.611594  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0017  hypothetical protein  53.85 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>