28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1402 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_0483  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  191  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1402  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  191  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.386495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1397  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  100 
 
 
101 aa  191  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0669  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  191  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.664868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1198  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  191  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0725407  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1530  hypothetical protein  99.01 
 
 
101 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2843  hypothetical protein  84.16 
 
 
169 aa  151  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4332  hypothetical protein  57.14 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.834965  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0310  pentapeptide MXKDX repeat protein  60 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109825  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1106  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  51.52 
 
 
83 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31289  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1106  hypothetical protein  51.52 
 
 
83 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227161  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0298  pentapeptide MXKDX repeat protein  55.1 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1196  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  53.26 
 
 
91 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0762518  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2530  hypothetical protein  55.67 
 
 
96 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.234183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1511  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  44.9 
 
 
107 aa  53.9  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.144611  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0540  hypothetical protein  49.43 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2570  pentapeptide MXKDX repeat protein  45.98 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296562  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3133  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  56.92 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal  0.206734 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2593  hypothetical protein  45.98 
 
 
93 aa  47.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5021  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  44.05 
 
 
77 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978776  normal  0.0965687 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2731  hypothetical protein  57.14 
 
 
83 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172905 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2991  pentapeptide MXKDX repeat protein  54.69 
 
 
83 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272043  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2814  pentapeptide MXKDX repeat protein  47.3 
 
 
79 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.873208  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1698  pentapeptide MXKDX repeat protein  39.39 
 
 
100 aa  44.3  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2179  hypothetical protein  53.97 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.565445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2665  pentapeptide MXKDX repeat protein  55.77 
 
 
81 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1517  hypothetical protein  39.53 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0017  hypothetical protein  40.45 
 
 
78 aa  40  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>