36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1511 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1511  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  100 
 
 
107 aa  192  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.144611  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0298  pentapeptide MXKDX repeat protein  58.65 
 
 
109 aa  90.1  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0310  pentapeptide MXKDX repeat protein  55.05 
 
 
109 aa  88.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109825  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0540  hypothetical protein  58.42 
 
 
93 aa  84.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2593  hypothetical protein  55.45 
 
 
93 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1517  hypothetical protein  55.21 
 
 
86 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3133  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  64.37 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal  0.206734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2991  pentapeptide MXKDX repeat protein  74.55 
 
 
83 aa  64.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272043  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2530  hypothetical protein  48.51 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.234183 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2731  hypothetical protein  52.33 
 
 
83 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172905 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4332  hypothetical protein  51.16 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.834965  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2570  pentapeptide MXKDX repeat protein  41.58 
 
 
94 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296562  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2179  hypothetical protein  59.09 
 
 
83 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.565445 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1530  hypothetical protein  44.9 
 
 
101 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2814  pentapeptide MXKDX repeat protein  46.99 
 
 
79 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.873208  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1402  hypothetical protein  44.9 
 
 
101 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.386495  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0483  hypothetical protein  44.9 
 
 
101 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1397  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  44.9 
 
 
101 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0669  hypothetical protein  44.9 
 
 
101 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.664868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1198  hypothetical protein  44.9 
 
 
101 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0725407  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2538  hypothetical protein  70.83 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1196  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  53.19 
 
 
91 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0762518  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1698  pentapeptide MXKDX repeat protein  39.39 
 
 
100 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2931  hypothetical protein  63.46 
 
 
78 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5021  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  39.56 
 
 
77 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978776  normal  0.0965687 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2752  pentapeptide MXKDX repeat protein  36.26 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2843  hypothetical protein  61.82 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0621  hypothetical protein  48.24 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4814  pentapeptide MXKDX repeat protein  63.04 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.901496  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0866  pentapeptide MXKDX repeat protein  40.48 
 
 
86 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3034  hypothetical protein  24.73 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.857374 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0198  hypothetical protein  43.62 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4104  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  44.78 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4053  hypothetical protein  54.55 
 
 
98 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0017  hypothetical protein  57.69 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2665  pentapeptide MXKDX repeat protein  56.25 
 
 
81 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>