18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2752 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2752  pentapeptide MXKDX repeat protein  100 
 
 		 98 aa  192  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1698  pentapeptide MXKDX repeat protein  47.78 
 
 		 100 aa  70.1  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0540  hypothetical protein  46.84 
 
 		 93 aa  62  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0298  pentapeptide MXKDX repeat protein  43.42 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0310  pentapeptide MXKDX repeat protein  42.11 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2530  hypothetical protein  41.76 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.234183 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4332  hypothetical protein  38.24 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.834965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2593  hypothetical protein  37.97 
 
 		 93 aa  52.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3133  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  37.66 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal  0.206734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2991  pentapeptide MXKDX repeat protein  44.07 
 
 		 83 aa  50.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272043  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4053  hypothetical protein  37.08 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2814  pentapeptide MXKDX repeat protein  38.75 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.873208  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1511  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  36.26 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.144611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2179  hypothetical protein  45.45 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.565445 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2731  hypothetical protein  36.25 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2570  pentapeptide MXKDX repeat protein  35.23 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1196  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  36.9 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0762518  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5021  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  36.92 
 
 		 77 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978776  normal  0.0965687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>