31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2814 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2814  pentapeptide MXKDX repeat protein  100 
 
 		 79 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.873208  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2530  hypothetical protein  62.67 
 
 		 96 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.234183 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2991  pentapeptide MXKDX repeat protein  71.19 
 
 		 83 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272043  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0540  hypothetical protein  51.16 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4053  hypothetical protein  56.52 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3133  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  65.08 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal  0.206734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2931  hypothetical protein  62.2 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2593  hypothetical protein  50.63 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0298  pentapeptide MXKDX repeat protein  48.15 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0310  pentapeptide MXKDX repeat protein  48.15 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4332  hypothetical protein  46.34 
 
 		 91 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.834965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2538  hypothetical protein  60.26 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1511  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  46.99 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.144611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1517  hypothetical protein  52.94 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2731  hypothetical protein  52.7 
 
 		 83 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2570  pentapeptide MXKDX repeat protein  45.98 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1698  pentapeptide MXKDX repeat protein  44.87 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2179  hypothetical protein  69.05 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.565445 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1196  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  46.99 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0762518  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2752  pentapeptide MXKDX repeat protein  38.75 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2843  hypothetical protein  48.65 
 
 		 169 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0198  hypothetical protein  38.36 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0483  hypothetical protein  47.3 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1402  hypothetical protein  47.3 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.386495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1397  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  47.3 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0669  hypothetical protein  47.3 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.664868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1198  hypothetical protein  47.3 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0725407  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1530  hypothetical protein  47.3 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0017  hypothetical protein  42.5 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5021  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  45.9 
 
 		 77 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978776  normal  0.0965687 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4814  pentapeptide MXKDX repeat protein  42.11 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.901496  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>