29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1196 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1196  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  100 
 
 		 91 aa  166  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0762518  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1106  hypothetical protein  72.53 
 
 		 83 aa  110  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227161  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1106  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  71.43 
 
 		 83 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4332  hypothetical protein  73.4 
 
 		 91 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.834965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2843  hypothetical protein  59.09 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0483  hypothetical protein  53.26 
 
 		 101 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1402  hypothetical protein  53.26 
 
 		 101 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.386495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1397  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  53.26 
 
 		 101 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1198  hypothetical protein  53.26 
 
 		 101 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0725407  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0669  hypothetical protein  53.26 
 
 		 101 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.664868  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1530  hypothetical protein  52.17 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0310  pentapeptide MXKDX repeat protein  55.43 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0298  pentapeptide MXKDX repeat protein  66.67 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0540  hypothetical protein  55.68 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1511  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  53.19 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.144611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2731  hypothetical protein  54.65 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172905 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2593  hypothetical protein  46.81 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2991  pentapeptide MXKDX repeat protein  51.76 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272043  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2530  hypothetical protein  52.81 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.234183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2814  pentapeptide MXKDX repeat protein  46.99 
 
 		 79 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.873208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4053  hypothetical protein  65.85 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2179  hypothetical protein  55.17 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.565445 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3133  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  54.05 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal  0.206734 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1698  pentapeptide MXKDX repeat protein  35.42 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2570  pentapeptide MXKDX repeat protein  48.86 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0198  hypothetical protein  37.66 
 
 		 166 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2752  pentapeptide MXKDX repeat protein  36.9 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1517  hypothetical protein  47.13 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2538  hypothetical protein  56.52 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>