21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1106 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1106  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  157  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227161  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1106  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  98.8 
 
 		 83 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1196  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  72.53 
 
 		 91 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0762518  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4332  hypothetical protein  68.48 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.834965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2843  hypothetical protein  57.95 
 
 		 169 aa  72  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0483  hypothetical protein  51.52 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1198  hypothetical protein  51.52 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0725407  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0669  hypothetical protein  51.52 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.664868  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1397  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  51.52 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1402  hypothetical protein  51.52 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.386495  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1530  hypothetical protein  50.51 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0540  hypothetical protein  53.95 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0298  pentapeptide MXKDX repeat protein  70.59 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2731  hypothetical protein  59.72 
 
 		 83 aa  48.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172905 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0310  pentapeptide MXKDX repeat protein  68.63 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2593  hypothetical protein  45.24 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2991  pentapeptide MXKDX repeat protein  62.5 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272043  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2665  pentapeptide MXKDX repeat protein  59.38 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3133  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  63.83 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal  0.206734 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5021  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  45.95 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978776  normal  0.0965687 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1511  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  48.57 
 
 		 107 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.144611  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>