36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0540 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0540  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  164  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0298  pentapeptide MXKDX repeat protein  68.09 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0310  pentapeptide MXKDX repeat protein  68.09 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2593  hypothetical protein  63.44 
 
 		 93 aa  97.8  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2991  pentapeptide MXKDX repeat protein  69.88 
 
 		 83 aa  88.6  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272043  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1511  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  58.42 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.144611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2731  hypothetical protein  61.29 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172905 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1517  hypothetical protein  56.82 
 
 		 86 aa  81.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3133  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  61.73 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal  0.206734 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2530  hypothetical protein  47.83 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.234183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2814  pentapeptide MXKDX repeat protein  51.16 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.873208  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2752  pentapeptide MXKDX repeat protein  46.84 
 
 		 98 aa  62  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1698  pentapeptide MXKDX repeat protein  42.86 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2570  pentapeptide MXKDX repeat protein  48.39 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4332  hypothetical protein  54.22 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.834965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2179  hypothetical protein  64.71 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.565445 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1196  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  55.68 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0762518  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2931  hypothetical protein  66.67 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1530  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1106  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  53.95 
 
 		 83 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2843  hypothetical protein  51.16 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0483  hypothetical protein  49.43 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1402  hypothetical protein  49.43 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.386495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1397  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  49.43 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0669  hypothetical protein  49.43 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.664868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1198  hypothetical protein  49.43 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0725407  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1106  hypothetical protein  53.95 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227161  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4053  hypothetical protein  49.43 
 
 		 98 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0621  hypothetical protein  47.06 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5021  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  48.65 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978776  normal  0.0965687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2538  hypothetical protein  67.39 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3034  hypothetical protein  23.4 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.857374 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2665  pentapeptide MXKDX repeat protein  66.67 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0198  hypothetical protein  40 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0866  pentapeptide MXKDX repeat protein  45.68 
 
 		 86 aa  44.3  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0017  hypothetical protein  41.98 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>