33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2570 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2570  pentapeptide MXKDX repeat protein  100 
 
 
94 aa  173  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296562  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4814  pentapeptide MXKDX repeat protein  62.77 
 
 
82 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.901496  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0310  pentapeptide MXKDX repeat protein  53.68 
 
 
109 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109825  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0298  pentapeptide MXKDX repeat protein  53.68 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2530  hypothetical protein  57.14 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.234183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3133  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  57.81 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal  0.206734 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0540  hypothetical protein  48.39 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2731  hypothetical protein  51.81 
 
 
83 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172905 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2843  hypothetical protein  49.4 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1511  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  41.58 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.144611  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2593  hypothetical protein  48.19 
 
 
93 aa  55.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2814  pentapeptide MXKDX repeat protein  45.98 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.873208  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2665  pentapeptide MXKDX repeat protein  71.43 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1530  hypothetical protein  45.98 
 
 
101 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2991  pentapeptide MXKDX repeat protein  46.99 
 
 
83 aa  50.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0483  hypothetical protein  45.98 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1402  hypothetical protein  45.98 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.386495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1397  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  45.98 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1198  hypothetical protein  45.98 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0725407  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0669  hypothetical protein  45.98 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.664868  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2931  hypothetical protein  47.5 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1517  hypothetical protein  43.96 
 
 
86 aa  47.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2179  hypothetical protein  45.95 
 
 
83 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.565445 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0017  hypothetical protein  50 
 
 
78 aa  47.4  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2538  hypothetical protein  54.39 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0866  pentapeptide MXKDX repeat protein  41.98 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1698  pentapeptide MXKDX repeat protein  37.84 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4332  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.834965  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5021  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  39.78 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978776  normal  0.0965687 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2752  pentapeptide MXKDX repeat protein  35.23 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1196  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  48.86 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0762518  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4053  hypothetical protein  39.24 
 
 
98 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0621  hypothetical protein  46.67 
 
 
87 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>